Ich habe einen Biomarker (LOG2 FC P) -Datensatz unter Verwendung eines linearen Anpassungsmodells mit Wiederholungsmessung analysiert, wie unten gezeigt

Jetzt möchte ich die Behandlungen (LEAD_TAG) zu jedem Zeitpunkt (Visit_Description) vergleichen, ohne alle möglichen Vergleichspaare zu generieren, die mit der LSMEans Differences Tukey HSD-Methode erstellt wurden (siehe Grafik unten):
- ist das möglich
- Ist das wichtig? (dh gibt es "Kosten" für den Vergleich aller Paare [36 Vergleiche] anstelle der gewünschten [6 Vergleiche])

Hallo @Thierry_S ,
Die Verwendung von ist kostenpflichtig Die paarweise Tukey-HSD-Methode berücksichtigt die Anzahl der Vergleiche, da die Korrektur angewendet wurde, um das Gesamt-Alpha auf dem angegebenen Niveau zu halten. Wenn Sie sich nur 3 ansehen müssen, zahlen Sie im Wesentlichen mit statistischer Leistung, indem Sie 36 korrigieren.
Ich würde eine der LSMeans Contrast-Optionen direkt neben Tukey HSD im Roten Dreieck für Ihre Interaktion zwischen Behandlung und Zeitpunkt verwenden. Sie können die linearen Kontraste entweder selbst festlegen, indem Sie LSMeans Contrast dreimal auswählen, oder indem Sie "Test Slices" verwenden, um jeden Faktor automatisch an einem Slice entlang des anderen Faktors zu testen. In Ihrem Fall bedeutet dies, dass Sie 6 Tests erhalten: drei Zeittests, einen für jede Behandlung, und drei Behandlungstests, einen für jede Behandlung. Es sind die letzten drei, die Sie möchten, und sie werden entsprechend gekennzeichnet (Baseline, Woche 2, Woche 8), und sie prüfen, ob Sie Anzeichen dafür haben, dass zum angegebenen Zeitpunkt eine Wirkung der Behandlung vorliegt.
Beachten Sie, dass diese Tests nicht für mehrere Vergleiche geeignet sind - die angegebenen p-Werte sind nicht angepasst. Bei drei geplanten Vergleichen dürfte eine Bonferroni-Korrektur am nützlichsten sein.
@julianisch