加載項用作BioConductor中QuasR（Quantify的縮寫和R中的短讀取）包的包裝器。它使用qAlign將單個或成對末端讀數與參考基因組對齊，並且未映射的讀數可選地進一步與其他參考對齊。導入後將生成BAM格式的預先存在的對齊。
實驗設計文件是製表符分隔的文本文件或sas7bdat文件，其中包含具有“FileName”和“SampleName”的列名稱;原始序列文件可以用gzip，bzip2或xz壓縮（擴展名為“gz”，“bz2”或“xz”）;需要參考基因組來創建比對指數和進一步的比對。
輸出結果：生成比對，並且可以在JMP基因組學中執行更快的分析，例如，啟動“從BAM生成計數”過程。它還創建了一個質量控制報告，其中包含序列質量和對齊統計圖。
引文：
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