加载项用作BioConductor中QuasR（Quantify的缩写和R中的短读取）包的包装器。它使用qAlign将单个或成对末端读数与参考基因组对齐，并且未映射的读数可选地进一步与其他参考对齐。导入后将生成BAM格式的预先存在的对齐。
实验设计文件是制表符分隔的文本文件或sas7bdat文件，其中包含具有“FileName”和“SampleName”的列名称;原始序列文件可以用gzip，bzip2或xz压缩（扩展名为“gz”，“bz2”或“xz”）;需要参考基因组来创建比对指数和进一步的比对。
输出结果：生成比对，并且可以在JMP基因组学中执行更快的分析，例如，启动“从BAM生成计数”过程。它还创建了一个质量控制报告，其中包含序列质量和对齐统计图。
引文：
Gaidatzis D，Lerch A，Hahne F，Stadler MB。QuasR：R.Bioinformatics 31（7）：1130-1132（2015）中的短读取的定量和注释。
Langmead B，Trapnell C，Pop M，Salzberg SL。短DNA序列与人类的超快速和记忆效率的比对
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