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JMP Genomics와의 유전 협회

JMP Genomics 게놈 및 기타 "-"데이터를 분석하기위한 전문적이면서도 광범위한 도구입니다.

표현 분석, GWAS, 예측 모델링 또는 식물 육종과 같은 JMP Genomics는 필요를 충족시키는 도구를 갖추고 있습니다.

이 블로그 시리즈는 데이터 가져 오기부터 시작하여 여러 가지 분석 파이프 라인을 통해 계속되는 유전 협회를 다루고 있습니다.

9 개의 블로그 게시물 각각에 대한 링크를 사용할 수있게되면 여기에 액세스 할 수 있습니다. 이번 주 회비는 JMP Genomics와의 유전 협회, Part 1 : 데이터 가져 오기 및 삭제 일련의 .txt 파일을 JMP로 가져 와서 데이터 세트를 조 변경 및 병합하고 분석을 위해 마커 데이터를 준비하는 방법을 다룹니다.

 

 

시리즈 개요

수입

1. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 1 : 데이터 가져 오기 및 삭제
   
   1. EDF 및 마커 데이터 가져 오기
   2. 조 변경 및 병합
   3. 레코딩 없음
   4. 숫자 형 유전자형
   5. 주석 가져 오기

기본 유전학 워크 플로

2. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 2 : 기본 유전학 워크 플로 (증례 통제)
   1. 마커 통계
   2. 마커 등록 정보
   3. 사례 - 통제

QK 혼합 모델

3. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 3a : 마커 기반 관계 매트릭스

1. K 매트릭스 압축

4. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 3b : 인구 구조 행렬
5. JMP Genomics와의 유전학, 3c 부 : QK 혼합 모델
6. JMP Genomics와의 유전 협회, 제 3 부 : 유전 협회를위한 QK 혼합 모델 워크 플로우
   1. PCA 및 인구 구조 행렬
   2. 마커 데이터의 관계 매트릭스
   3. QK 혼합 모델

링크 매핑 및 QTL

7. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 4 : 기본 링키지 매핑
8. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 5 : QTL 단일 마커 분석

GWAS

9. JMP Genomics와의 유전 협회, Part 6 : SNP-Trait Association

JMP Genomics는 유전자, 게놈 및 기타 "omic"데이터를 분석하기위한 전문적이면서도 광범위한 도구입니다. 표현 분석, GWAS, 예측 모델링 또는 식물 육종과 같은 JMP Genomics는 필요를 충족시키는 도구를 갖추고 있습니다. 이 블로그 시리즈 (4 개 시리즈 중 첫 번째 시리즈)는 데이터 가져 오기부터 시작하여 여러 가지 분석 파이프 라인을 통해 계속되는 유전 협회를 처리합니다.

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