用于植物育种分析和预测的JMP基因组学<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />嗨，
我一直在关注Russ Wolfinger关于育种分析和预测的演讲。唉，我无法在自己的电脑上复制他。我怀疑我错过了一些重要的东西。例如，我无法复制他如何设置4-5岭回归分析。
是否有育种的书面教程？我很高兴看到这一点。
谢谢。
雅恩
回复：JMP基因组学用于植物育种分析和预测嗨Jahn，
首先，在JMP Genomics菜单中找到“交叉验证和模型比较”过程。此过程的菜单路径为：“预测建模>>模型比较” 交叉验证和模型比较“。完成此过程后，单击它以打开过程窗口。在新窗口中，转到“常规”选项卡，您可以在其中选择包含要比较的模型的设置文件的文件夹，方法是单击“设置文件的文件夹”字段的“选择”按钮。选择设置文件所在的文件夹路径。如果使用“Predictive Model Review”过程创建设置文件，则选择“Predictive Model Review”的输出文件夹作为“设置文件的文件夹”。此时，您将在左侧面板中看到所有可用的设置文件。单击并突出显示要运行交叉验证和模型比较的所有设置，然后单击箭头“ - >”符号将其发送到右侧面板。您也可以在“常规”选项卡中设置输出文件夹。现在，进入“分析”选项卡并选择“保持方法”（一个好的方法是随机分区），同时选择“保持大小，指定为：”（“K表示K-Fold或1 / K Hold-Out“非常标准，所以你可以使用它。接下来，设置“K表示K-Fold或1 / K Hold-Out”的数字（如果样本大小为100并选择K = 4，则数据集将分为四个部分，依次为每个部分它们将用作训练数据集，其余部分用作测试集）。最后，为“随机保持迭代次数”设置一个数字（这是交叉验证将被处理的次数;越大越好，但是，它可能是耗时的，所以我建议尝试5）。您可以将所有其他选项保留为默认选项。
祝你的分析好运！
回复：JMP基因组学用于植物育种分析和预测你好，我们又见面了，
我想出了自己的一个:-)据我所知，在设置Russ Wolfinger的几个模型时，你必须按下每个模型的“Update Review”按钮。
我还没弄清楚他是如何根据BLUP进行模型比较的。有人能帮我一下吗？
谢谢
雅恩
