森林圖片插件森林圖插件垂直顯示多個置信度或可信區間。 使用者從資料表中提供每個區間的下限和上限、中心值(可以代表平均效果)和標籤。 使用者可以提供第二中心值以呈現圖中的附加總和值(例如,中位數)。 顏色選項可讓您反白顯示排除空值(預設為 0)的間隔,並且此顏色會根據間隔高於還是低於空值而變化。 在空值處繪製一條垂直參考線。 圖中的間隔會依照其在資料表中的順序進行排序。
版本 3 允許使用者指定一個變數來指示中心值的大小。中心值的面積與標記大小成正比。使用者可以指定中心符號的最小尺寸,應用縮放因子來控制符號尺寸,以及透明度因子,以便完全包含在中心值符號內的狹窄間隔可見。這不會影響中心值 2 標記的大小,該標記已從菱形更改為管道以提高可見性。請參閱 JMP 博客,以了解包含新提供的尼卡地平資料的森林圖的一些範例。
下圖顯示了一個範例的對話框,該範例使用 Mehrotra & Heyse (2004) 的 40 種不良事件的貝葉斯分層模型中的 20,000 個 MCMC 樣本的匯總統計資料。

下圖顯示了基於下 2.5% 和上 97.5% 分位數的 95% 等尾可信區間。使用樣本數據,有興趣的使用者可以透過更改下限和上限來創建最高後驗密度 (HPD) 區間的類似圖。

Mehrotra DV 和 Heyse JF。 (2004)。 使用錯誤發現率評估臨床安全性資料。 醫學研究統計方法 13:227-238。
版本 4 修正了儲存到資料表時重現繪圖時的錯誤,並在標籤為「總計」或「總體」時新增獨特的符號。請參閱 RoseMeta.jmp 產生的下圖。 中心氣泡的大小根據特定子組的受試者總數而定。總體信賴區間(代表整個試驗群體)以星號顯示,而不是依受試者數量決定大小的氣泡。數據來自一項針對第 2 型糖尿病患者的臨床試驗,旨在評估過度心血管風險羅格列酮(Home 等人, 2009)。

Home PD、Pocock SJ、Beck-Nielsen H、Curtis PS、Gomis R、Hanefeld M、Jones NP、Komajda M 和 JJV McMurray。 (2009)。 評估羅格列酮在第 2 型糖尿病口服藥物聯合治療中的心血管結局 (RECORD):一項多中心、隨機、開放標籤試驗。 柳葉刀373:2125–2135。
版本 5 新增了兩項新功能。第一個功能是新增信賴區間文字的選項。 這允許用戶沿著右軸包含文字字串。 這可能包括特定子組交互作用測試的文本,或如此處所示,風險比的估計值和 95% 信賴區間羅格列酮與對照。 第二個功能是反轉軸順序的複選框。 這節省了必須顛倒垂直軸順序的手動步驟。 如果沒有第二個功能,使用第一個功能提供的文本需要兩個軸分別反轉。透過相反的順序,總體組被放置在圖的底部。 取消選取該選項時,「總體」將放置在頂部。
版本 6 修正了將森林圖腳本儲存到資料表並重新執行時會導致錯誤的錯誤。
版本 7 在對話方塊中新增了子群組角色,以便更輕鬆地建立帶有參考線的子群組森林圖,以及根據所選顏色首選項(預設為黑色)為中心值 2 著色的選項。基於上述對話方塊選擇的結果圖如下所示。

版本 8 修正了使用「標記大小」選項時 JMP 13 中的錯誤。
數據視覺化生命科學回覆:森林圖插件理查德,這是一個非常寶貴的插件。 我無法確定如何將點估計的形狀從實心圓形更改為實心正方形。 這需要更改 jsl 還是有隱藏選項?
感謝
艾弗道格拉斯,醫學博士
科羅拉多州丹佛市
回覆:森林圖插件嗨理查德
我在 (V8) 中使用了森林圖,其流行率(流行率文字字串和 95% CI)位於右側(如上例所示),並將腳本複製到我的 JSL 檔案中。當我運行整個腳本時,流行率從最小到最大排序,獨立於左側的數字或標籤。當我將流行率向左移動時,它們再次正確。 這是我能找到的唯一解決方案。 我還嘗試在沒有加載項的情況下在 graphbuilder 中繪製相同的數據,並且發生了相同的事情。我在 v14.3 和 15.0 都看到了這種行為。也許我在做一些愚蠢的事情,但無論如何,值得警告的是檢查你的情節。
乾杯
甘特
回覆:森林圖插件<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />嗨理查德,
我剛剛使用新範例測試了 V7 插件的新子組選項,一切都很好。
此外,我注意到,對於我的範例,如果您使用中心值的變數名稱作為森林圖 x 軸的標籤,它就適合。 請檢查您是否同意這一點。 否則這不是一個主要問題,因為 x 軸的標籤可以輕鬆編輯。
總的來說,這是我所知道的最用戶友好和靈活的森林圖程式。
謝謝並致以誠摯的問候
溫弗里德
回覆:森林圖插件嗨溫弗里德。 我已經關閉了隱藏工具列的選項。 現在您應該可以在 V5 中看到它。 您向 JMP 日誌報告的問題可能是由新增圖形腳本 () 引起的。 我可以嘗試探索為什麼會發生這種情況,但可能沒有辦法解決。 但是,我確實注意到,如果資料表開啟並且是最新的,重新開啟關閉的日誌將正確執行繪圖。 這將是一個額外的步驟,但可以向日誌檔案添加一些文字以開啟資料表並使其成為當前資料表。 例如,
dt = Open("C:\Users\rizink\Desktop\rosemeta.jmp", 不可見);
當前資料表(dt);
關於最後一點,此加載項的工作原理是在標籤中列出的變數的資料表中新增值排序屬性。 這樣做是為了輕鬆維護森林圖中資料表的順序(或相反)。 否則,預設行為按字母順序對行進行排序,這可能無法提供所需的結果。 下面是建立了森林圖的資料表。 子組上的星號(手所在的位置)將顯示變數上存在值排序。 單擊它將打開該列的屬性,並且可以透過單擊對話方塊中的“刪除”來刪除值排序。可以對資料進行排序,並重新產生繪圖。一般來說,應在運行和保存繪圖之前確定順序。

回覆:森林圖插件嗨溫弗里德。 抱歉回覆延遲。 上面為 Home 等人的研究產生的亞組圖是透過以下方式產生的。 此對話框的運作方式如上圖所示。 然後,我單擊紅色三角形選項以獲取圖形生成器控制面板,然後拖曳等級以將其嵌套在 y 軸上。 我需要拉出 x 軸以使其看起來更好。

對於子組之間的線,請右鍵單擊軸並選擇軸設定。 然後開啟第二個標籤(標籤行 2)上的「顯示網格」。 這將添加線來劃分子組。

回覆:森林圖插件同時,我在第二個專案中成功使用了 Forest Plot Add-Inn。 標記大小選項效果很好,只需進行一點實驗即可正確設定最小大小,以使小團體可以看到中心值。 我想回報以下小問題:
- 儘管我已將 JMP 首選項設定為從不自動隱藏,但工具列在圖中不可用,
- 當我將森林圖保存到日記中時,當我稍後重新打開日記時,圖被損壞,
- 當我將森林圖的腳本儲存到資料表,然後對錶的行進行排序時,腳本無法正確重新運行。
總的來說,Forest Plot Add-Inn 非常有用,甚至可以在薈萃分析之外的許多情況下使用。
回覆:森林圖插件我在相當複雜的情況下使用了插件 V4.0,發現它工作得非常好。 兩個小問題如下:
- 當我使用比例標記大小時,具有最小樣本大小的研究標記不再可見,而是隱藏在置信區間線中。 也許在這種情況下,應該可以將此消失標記的形狀編輯為垂直線。
- 我有興趣應用上述 Home 等人的森林圖所示的研究分組。但我沒有找到實現此目的的選項。 因此,我插入了水平彩色分隔線來分隔研究組。
一般來說,我認為在此類森林圖中使用顏色很有幫助,我鼓勵在加載項中進一步使用顏色。 森林圖通常被視為黑白的原因之一可能是元分析程式的較便宜的標準版本不支援顏色,但較昂貴的版本有時支援顏色。 對我來說,顏色的使用總體上是 JMP 的一個重要優勢。
回覆:森林圖插件非常感謝,理查德。 對 CI 進行著色固然很好,但實際上沒有必要。 我見過的幾乎所有森林圖都是黑白的。
回覆:森林圖插件嗨,菲爾,
我已經弄清楚如何透過允許您選擇氣泡的大小變數和縮放變數來滿足您的要求。 我仍在嘗試解決的一件事是,當氣泡的大小可能完全包含 CI 時,對置信區間線進行著色。這種情況可能只發生在小尺寸和大尺寸之間有較大差異的情況下。 我應該很快就會有東西給你。
抱歉耽擱了! 感謝您的耐心和好主意!
理查
回覆:森林圖插件嗨,菲爾。 這是一個好主意。 我已經研究過了,還沒有發現任何明顯的東西,但我會盡力繼續努力。
回覆:森林圖插件是否可以在對話方塊中新增另一個字段,使標記大小成為變數? 例如,我正在比較多項試驗,並希望用更大的標記來代表更大的試驗(更多受試者)
回覆:森林圖插件你好理查德
如果置信區間文字Y軸標籤相同,它們將統一為一個標籤,但如何顯示所有重複?