산림 계획 추가 기능Forest Plot 추가 기능은 여러 가지 신뢰도 또는 신뢰 구간을 수직으로 표시합니다. 사용자는 데이터 테이블에서 각 구간에 대한 하한 및 상한, 중앙값(평균 효과를 나타낼 수 있음) 및 레이블을 제공합니다. 사용자는 그림에 추가 요약 값(예: 중앙값)을 표시하기 위해 두 번째 중심 값을 제공할 수 있습니다. 색상 옵션을 사용하면 Null 값(기본값 0)을 제외한 간격을 강조 표시할 수 있으며, 이 색상은 간격이 Null 값 위인지 아래인지에 따라 달라집니다. Null 값에는 점선으로 된 수직 참조선이 그려집니다. 간격은 데이터 테이블의 순서에 따라 그림에서 정렬됩니다.
버전 3에서는 사용자가 중심값의 크기를 나타내는 변수를 지정할 수 있습니다.중심값의 면적은 마커 크기에 비례합니다.사용자는 중심 기호의 최소 크기를 지정하고, 기호 크기를 제어하기 위한 배율 인수와 중심 값 기호 내에 완전히 포함된 좁은 간격이 표시되도록 투명도 계수를 적용할 수 있습니다.이는 가시성을 높이기 위해 다이아몬드에서 파이프로 변경된 Center Value 2 마커의 크기에는 영향을 미치지 않습니다.새로 제공된 니카르디핀 데이터를 사용한 숲 그림의 몇 가지 예를 보려면 JMP 블로그를 참조하세요.
아래 그림은 Mehrotra & Heyse(2004)의 40개 이상 사례에 대한 베이지안 계층 모델의 20,000개 MCMC 샘플에 대한 요약 통계를 사용하는 예에 대한 대화 상자를 표시합니다.
아래 그림은 하위 2.5% 및 상위 97.5% 분위수를 기준으로 95% 동일 꼬리 신뢰 구간을 표시합니다.관심 있는 사용자는 샘플 데이터를 사용하여 하한 및 상한을 변경하여 최고 사후 밀도(HPD) 간격에 대한 유사한 플롯을 생성할 수 있습니다.
메로트라 DV & Heyse JF. (2004). 임상 안전성 데이터 평가를 위한 허위 발견률의 사용. 의학 연구의 통계적 방법 13: 227-238.
버전 4에서는 데이터 테이블에 저장할 때 플롯을 재현할 때 발생하는 버그를 수정하고 레이블이 "전체" 또는 "전체"일 때 고유한 기호를 추가합니다.RoseMeta.jmp에서 생성된 아래 그림을 참조하세요. 중앙 거품은 특정 하위 그룹의 총 피험자 수에 따라 크기가 결정됩니다.피험자 수에 따라 크기가 조정된 거품 대신 전체 신뢰 구간(전체 시험 모집단을 나타냄)이 별표로 표시됩니다.데이터는 과도한 심혈관 위험을 평가하기 위해 제2형 당뇨병 환자를 대상으로 한 임상 시험에서 나온 것입니다. 로시글리타존(Home et al., 2009).
홈 PD, Pocock SJ, Beck-Nielsen H, Curtis PS, Gomis R, Hanefeld M, Jones NP, Komajda M & JJV McMurray. (2009). 제2형 당뇨병에 대한 경구제 병용 요법에서 심혈관 결과에 대해 평가된 Rosiglitazone(RECORD): 다기관, 무작위, 공개 라벨 시험. 랜싯 373: 2125-2135.
버전 5에는 두 가지 새로운 기능이 추가되었습니다.첫 번째 기능은 신뢰 구간 텍스트를 추가하는 옵션입니다. 이를 통해 사용자는 오른쪽 축을 따라 텍스트 문자열을 포함할 수 있습니다. 여기에는 특정 하위 그룹에 대한 상호 작용 테스트를 위한 텍스트가 포함될 수 있으며, 여기에 표시된 대로 하위 그룹의 위험 비율에 대한 추정치와 95% 신뢰 구간이 포함될 수 있습니다. 로시글리타존 대 대조군. 두 번째 기능은 축 역순 체크박스입니다. 이렇게 하면 수직 축의 순서를 반대로 해야 하는 수동 단계가 절약됩니다. 이 두 번째 기능이 없으면 첫 번째 기능을 사용하여 제공되는 텍스트 두 축을 별도로 반전시켜야 합니다.역순으로 하면 전체 그룹이 그림의 아래쪽에 배치됩니다. 옵션을 체크 해제하면 전체가 상단에 배치됩니다.
버전 6에서는 Forest Plot 스크립트를 데이터 테이블에 저장하고 다시 실행할 때 오류가 발생하는 버그가 수정되었습니다.
버전 7에서는 하위 그룹 역할을 대화 상자에 추가하여 기준선이 있는 하위 그룹 산림 도표를 보다 쉽게 생성할 수 있으며, 선택한 색상 기본 설정에 따라 중심 값 2에 색상을 지정할 수 있는 옵션(기본값은 검은색)이 추가되었습니다.위의 대화 상자 선택을 기반으로 한 결과 플롯이 아래에 표시됩니다.
버전 8에서는 마커 크기 옵션을 사용할 때 JMP 13의 버그가 수정되었습니다.
데이터 시각화생명 과학Re: 산림 계획 추가 기능Richard 이것은 매우 귀중한 추가 기능입니다. 점 추정의 모양을 채워진 원에서 채워진 사각형으로 변경하는 방법을 설정할 수 없습니다. jsl을 변경해야 합니까, 아니면 숨겨진 옵션이 있습니까?
고마워
아이버 더글러스, MD
덴버 콜로라도
Re: 산림 계획 추가 기능안녕하세요 리처드
위의 예에서와 같이 오른쪽에 유병률(유병률 텍스트 문자열 및 95% CI)이 있는 포리스트 플롯 추가 기능(V8)을 사용하고 스크립트를 내 JSL 파일에 복사했습니다.전체 스크립트를 실행했을 때 출현율은 왼쪽의 그림이나 레이블과 관계없이 가장 작은 것부터 가장 큰 것까지 스스로 정렬되었습니다.보급률을 왼쪽으로 옮겼더니 다시 정확해졌습니다. 이것이 내가 찾을 수 있는 유일한 해결 방법이었습니다. 또한 추가 기능 없이 graphbuilder에서 동일한 데이터를 플롯하려고 시도했지만 동일한 일이 발생했습니다.v14.3과 15.0에서 이 동작을 보았습니다. 내가 멍청한 짓을 하고 있을지도 모르지만, 어쨌든 플롯을 확인하라는 경고를 받을 가치가 있습니다.
건배
군터
Re: 산림 계획 추가 기능<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />안녕하세요, 리차드,
방금 새 예제를 사용하여 V7 추가 기능의 새 하위 그룹 옵션을 테스트했는데 모든 것이 정상이었습니다.
또한 내 예에서는 중심 값의 변수 이름을 산림 도표의 x축 레이블로 사용하는 경우 적합할 것이라는 점을 알았습니다. 이에 동의하실 수 있는지 확인해 주시기 바랍니다. 그렇지 않으면 x축의 레이블을 쉽게 편집할 수 있으므로 이는 큰 문제가 되지 않습니다.
전반적으로 이것은 내가 알고 있는 가장 사용자 친화적이고 유연한 Forest Plot 프로그램입니다.
감사합니다.
윈프리트
Re: 산림 계획 추가 기능안녕하세요 윈프리드입니다. 도구 모음을 숨기는 옵션을 해제했습니다. 이제 V5에서 볼 수 있습니다. JMP 저널에 보고하신 문제는 그래픽 스크립트 추가()로 인해 발생했을 가능성이 높습니다. 왜 이런 일이 발생하는지 알아보려고 노력할 수 있지만 해결 방법이 없을 수도 있습니다. 그러나 데이터 테이블이 열려 있고 최신 상태인 경우 닫힌 저널을 다시 열면 플롯이 올바르게 실행된다는 것을 알았습니다. 추가 단계이기는 하지만 저널 파일에 일부 텍스트를 추가하여 데이터 테이블을 열고 최신 상태로 만드는 것이 가능할 수도 있습니다. 예를 들어,
dt = Open("C:\Users\rizink\Desktop\rosemeta.jmp", 보이지 않음);
현재 데이터 테이블(dt);
마지막 지점과 관련하여 추가 기능은 레이블에 나열된 변수에 대한 데이터 테이블에 값 순서 속성을 추가하여 작동합니다. 이는 Forest Plot에서 데이터 테이블의 순서(또는 그 반대)를 쉽게 유지하기 위해 수행됩니다. 그렇지 않으면 기본 동작이 행을 알파벳순으로 정렬하므로 원하는 내용이 제공되지 않을 수 있습니다. 아래는 Forest Plot이 생성된 데이터 테이블입니다. 하위 그룹(손이 있는 곳)의 별표는 변수에 값 순서가 있음을 나타냅니다. 이를 클릭하면 이 열의 속성이 열리고 대화 상자에서 "제거"를 클릭하면 값 순서를 제거할 수 있습니다.데이터를 정렬하고 플롯을 다시 생성할 수 있습니다.일반적으로 플롯을 실행하고 저장하기 전에 순서를 결정해야 합니다.
Re: 산림 계획 추가 기능안녕하세요 윈프리드입니다. 답변이 늦어서 죄송합니다. 위에서 Home et al 연구를 위해 생성된 하위 그룹 그림은 다음과 같은 방식으로 생성되었습니다. 대화 상자는 그래픽에서 위와 같이 실행되었습니다. 그런 다음 빨간색 삼각형 옵션을 클릭하여 그래프 빌더 제어판을 표시한 다음 레벨을 드래그하여 y축에 중첩시킵니다. 좀 더 보기 좋게 만들려면 x축을 드래그해야 합니다.
하위 그룹 사이의 선의 경우 축을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 축 설정을 선택합니다. 그런 다음 두 번째 탭(레이블 행 2)에서 그리드 표시를 켭니다. 이렇게 하면 하위 그룹을 나누는 선이 추가됩니다.
Re: 산림 계획 추가 기능한편 저는 두 번째 프로젝트에서 Forest Plot Add-Inn을 성공적으로 사용했습니다. 마커 크기 옵션은 잘 작동합니다. 소규모 그룹에 중앙 값이 표시되도록 최소 크기를 올바르게 설정하려면 약간의 실험만 하면 됩니다. 다음과 같은 사소한 문제를 신고하고 싶습니다.
- JMP 기본 설정을 자동 숨기기 안 함으로 설정했지만 플롯에서 도구 모음을 사용할 수 없습니다.
- 산림 플롯을 저널에 저장한 후 나중에 저널을 다시 열면 플롯이 손상되었습니다.
- 산림 플롯의 스크립트를 데이터 테이블에 저장한 후 테이블의 행을 정렬하면 스크립트가 제대로 다시 실행되지 않습니다.
일반적으로 Forest Plot Add-Inn은 매우 유용하며 메타 분석 외에도 다양한 상황에서 사용할 수 있습니다.
Re: 산림 계획 추가 기능저는 다소 복잡한 상황에서 추가 기능 V4.0을 사용해 보았는데 정말 잘 작동하는 것으로 나타났습니다. 두 가지 사소한 문제는 다음과 같습니다.
- 비례 마커 크기를 사용하면 표본 크기가 가장 작은 연구의 마커가 더 이상 표시되지 않고 신뢰 구간 선에 숨겨집니다. 아마도 이 경우 사라지는 마커의 모양을 수직선으로 편집하는 것이 가능할 것입니다.
- 위의 Home et al의 Forest Plot에 표시된 대로 연구의 하위 그룹화를 적용하는 데 관심이 있었습니다. 하지만 이것을 구현할 옵션을 찾지 못했습니다. 그래서 연구 그룹을 구분하기 위해 가로 색상 구분선을 삽입했습니다.
일반적으로 나는 그러한 숲 플롯에서 색상을 사용하는 것이 유용하다고 생각하며 추가 기능에서 색상을 더 많이 사용하도록 권장합니다. 산림 도표가 일반적으로 흑백으로 표시되는 한 가지 이유는 메타 분석 프로그램의 저렴한 표준 버전이 색상을 지원하지 않지만 더 비싼 버전이 색상을 지원하는 경우도 있기 때문일 수 있습니다. 나에게 있어 색상 사용은 JMP의 중요한 강점입니다.
Re: 산림 계획 추가 기능정말 고마워요, 리차드. CI를 색칠하는 것은 좋지만 꼭 필요한 것은 아닙니다. 내가 본 거의 모든 산림 지역은 흑백이었습니다.
Re: 산림 계획 추가 기능안녕, 필,
거품에 대한 크기 조정 변수와 크기 조정 변수를 선택할 수 있도록 하여 귀하의 요청을 수용하는 방법을 알아냈습니다. 제가 아직 해결하려고 하는 한 가지는 거품 크기에 CI가 완전히 포함될 수 있을 때 신뢰 구간 선에 색상을 지정하는 것입니다.이는 작은 크기와 큰 크기 사이의 차이가 큰 경우에만 발생할 가능성이 높습니다. 곧 당신을 위한 뭔가를 준비해야 합니다.
지연 돼서 죄송합니다! 인내심을 갖고 좋은 아이디어를 주셔서 감사합니다!
리차드
Re: 산림 계획 추가 기능안녕, 필. 이것은 좋은 생각입니다. 조사해 봤지만 아직 뚜렷한 것을 발견하지 못했지만 계속해서 노력하겠습니다.
Re: 산림 계획 추가 기능마커 크기를 변수로 만드는 다른 필드를 대화 상자에 추가할 수 있습니까? 예를 들어 여러 실험을 비교하고 있으며 더 큰 마커를 사용하여 더 큰 실험(더 많은 피험자)을 나타내고 싶습니다.
Re: 산림 계획 추가 기능안녕하세요 리차드 씨
confidence interval text의 Y 축 라벨이 동일하다고 하나로 통일되어 버립니다만, 중복하는 것도 모두 표시하려면 어떻게 하면 좋을까요.
