Dieses JMP-Arbeitsblatt enthält Umweltdaten von den Austral-Inseln in Französisch-Polynesien und den Cookinseln sowie molekulare und physiologische Daten von 43 Korallenproben (von denen eine ausgeschlossen wurde, da es sich um eine Nichtzielart handelte). Meine Ziele waren, die Beziehung zwischen Umwelt und Physiologie zu untersuchen und Ausreißer zu identifizieren. Obwohl ich 10 Reaktionsvariablen in den Korallenproben gemessen habe (maximale Kolonielänge, planare Oberfläche, RNA/DNA-Verhältnis, Symbiodinium GCP [Dichte der Dinoflagellaten innerhalb der Koralle] und sechs Gen-mRNAs), habe ich nur das RNA/DNA-Verhältnis, Symbiodinium, berücksichtigt GCP und die ersten fünf Gene in der Datenanalyse. Ich habe sowohl univariate Ansätze (z. B. ANOVA und schrittweise Regression) als auch multivariate Ansätze (MANOVA, PCA, MDS) verwendet und festgestellt, dass die Wirtskorallenart im Allgemeinen der wichtigste „Umweltfaktor“ (dh der wichtigste Treiber von Variation). Für multivariate Ansätze habe ich die Werte in Z-Scores konvertiert, sodass sie alle auf derselben Skala liegen. Ich habe die Mahalanobis-Distanz für jede Probe berechnet, da ich tatsächlich denke, dass dies der interessanteste Parameter ist, der in einer Koralle gemessen werden kann (bei der wir nicht WISSEN, was gesund ist, wie wir es beim Menschen tun); Der Grad der Abweichung einer Probe vom mittleren Schwerpunkt kann, wie sich herausstellt, der wichtigste Faktor für die Bestimmung sein, ob eine Koralle für den Klimawandel anfällig ist. Siehe zum Beispiel den in die Tabelle geschriebenen PCA-Plot. Ich denke, Sie würden zustimmen, dass Kolonie 88.2 "interessant" sein könnte. Die meisten Leute würden es jedoch aufgrund seines Ausreißerstatus wegwerfen! Nun bleibt die Frage: Sind Ausreißer die „stärksten“ Korallen oder die schwächsten? Ich weiß es nicht, will es aber herausfinden.
Kurz gesagt, ich versuche, einen Weg zu entwickeln, um Korallen mit abweichendem Verhalten zu identifizieren, ohne zu wissen, was gesund ist. Dies ist eine knifflige Frage, und ich weiß nicht, ob sich jemand in anderen Bereichen mit diesem Problem befasst hat (ich weiß mit Sicherheit, dass niemand auf dem Gebiet der Korallenriffe dies getan hat). Wenn Sie Ideen zu diesem Thema haben, zögern Sie bitte nicht, sich zu melden.
https://public.jmp.com/packages/Principal-Components-on-Correlations/js-p/5c16dba996f7cc0eec8b4bbc
(Bitte teilen Sie mir mit, wenn dieser öffentliche JMP-Link nicht funktioniert.)
Danke Anderson.@abmayfield JMP Public Link funktioniert bei mir.Interessantes Problem und Analyse.
