Esta hoja de trabajo de JMP contiene datos ambientales de las Islas Austral de la Polinesia Francesa y las Islas Cook, así como datos fisiológicos + moleculares de 43 muestras de coral (una de las cuales se ha excluido debido a que no era una especie objetivo). Mis objetivos fueron analizar la relación entre el entorno y la fisiología, así como identificar valores atípicos. Aunque medí 10 variables de respuesta en las muestras de coral (longitud máxima de colonias, área de superficie planar, relación ARN / ADN, Symbiodinium GCP [densidad de dinoflagelados en el coral] y seis ARNm de genes), solo consideré la relación ARN / ADN, Symbiodinio GCP, y los primeros cinco genes en el análisis de datos. Utilicé enfoques univariados (p. Ej., ANOVA y regresión por pasos) y enfoques multivariados (MANOVA, PCA, MDS) y descubrí que, en general, la especie de coral hospedera era el factor "ambiental" más importante (es decir, el impulsor más importante de variación). Para los enfoques multivariados, convertí los valores en puntajes z para que todos estuvieran en la misma escala. Calculé la distancia de Mahalanobis para cada muestra, ya que creo que este es el parámetro más interesante para medir en un coral (en el que no SABEMOS lo que constituye saludable, como lo hacemos en humanos); el grado de desviación de una muestra del centroide medio puede, como resultado, ser el factor más importante para determinar si un coral es susceptible al cambio climático. Ver el gráfico de PCA escrito en la tabla, por ejemplo. Creo que estarías de acuerdo en que la colonia 88.2 podría ser "interesante". Sin embargo, la mayoría de la gente lo tiraría, debido a su estado de valor atípico. Ahora la pregunta sigue siendo: ¿son atípicos los corales "más fuertes" o los más débiles? No lo sé, pero el objetivo es averiguarlo.
En resumen, estoy tratando de desarrollar una manera de identificar a los corales de comportamiento aberrante en ausencia de saber lo que constituye saludable. Esta es una pregunta difícil, y no sé si alguien ha tratado este tema en otros campos (sé que no hay nadie en el campo de los arrecifes de coral). Si tiene alguna idea sobre este tema, no dude en participar.
https://public.jmp.com/packages/Principal-Components-on-Correlations/js-p/5c16dba996f7cc0eec8b4bbc
(Por favor, hágame saber si este enlace público JMP no funciona)
Gracias Anderson.@abmayfield El enlace público de JMP funciona para mí.Interesante problema y análisis.
