이 JMP 워크 시트에는 43 개의 산호 샘플 (그 중 하나는 비 표적 종 이었으므로 그 중 하나는 제외되었습니다)의 분자 + 생리 데이터뿐만 아니라 프랑스 폴리네시아 및 쿡 아일랜드의 호주 제도의 환경 데이터가 포함되어 있습니다. 나의 목표는 환경과 생리학의 관계를 관찰하고 특이 치를 확인하는 것이 었습니다. 내가 산호 샘플 (최대 식민지 길이, 평면 표면적, RNA / DNA 비율, Symbiodinium GCP [산호 내 dinoflagellates의 밀도], 그리고 6 개의 유전자 mRNA)에서 10 개의 반응 변수를 측정했지만, RNA / DNA 비율 인 Symbiodinium GCP 및 데이터 분석에서 처음 5 개의 유전자를 포함합니다. 나는 단 변량 접근법 (ANOVA와 단계적 회귀와 같은)과 다변량 접근법 (MANOVA, PCA, MDS)을 사용하였고, 일반적으로 숙주 산호 종은 가장 중요한 "환경 적 요인"(즉, 변화). 다 변수 접근법의 경우 값을 모두 같은 척도가되도록 z 점수로 변환했습니다. 나는 실제로 이것이 산호에서 측정하는 가장 흥미로운 매개 변수라고 생각하기 때문에 각 샘플에 대한 마할 라 노비스 거리를 계산했습니다. (우리가 인간에서하는 것처럼 건강을 구성하는 것을 알지 못합니다.) 산호가 기후 변화에 민감한 지 여부를 결정하는 가장 중요한 요소는 평균 중 심에서 샘플이 벗어나는 정도입니다. 예를 들어 테이블에 기록 된 PCA 플롯을보십시오. 나는 당신이 식민지 88.2가 "재미있을 것"이라는 것에 동의 할 것이라고 생각한다. 하지만 대부분의 사람들은 이상한 상태로 인해 버립니다. 이제 문제는 남아 있습니다 : "가장 강한"산호 또는 가장 약한 산란은 이상치입니까? 나는 모르지만 알아내는 것을 목표로 삼는다.
요컨대, 나는 건강을 구성하는 것이 무엇인지 알지 못하는 사이에 비정상적으로 행동하는 산호를 식별 할 수있는 방법을 개발하려고합니다. 이것은 까다로운 질문이며, 누군가 다른 분야에서이 문제를 다루었는지 나는 알지 못합니다 (나는 산호초 필드에 아무도없는 것을 압니다.). 이 문제에 대한 아이디어가 있으시면 언제든지 연락하십시오.
https://public.jmp.com/packages/Principal-Components-on-Crelrelations/js-p/5c16dba996f7cc0eec8b4bbc
(이 JMP 공개 링크가 작동하지 않는지 알려주십시오)
고마워 앤더슨.뿡 빵뀨 JMP 공용 링크가 저에게 효과적입니다.흥미로운 문제와 분석.
