Correla Y con il componente aggiuntivo XQuesto componente aggiuntivo genera una tabella di correlazioni e valori p da Y specificato rispetto alle colonne X specificate. Per impostazione predefinita, la tabella risultante include correlazioni parametriche e non parametriche e valori p (compresi i valori p corretti per FDR) , così come le immagini del grafico a dispersione e uno script heatmap salvato nella tabella. Se salvata, la colonna delle immagini del grafico a dispersione viene contrassegnata come colonna etichetta e passando con il mouse sopra i punti nella mappa di calore rivelerà il grafico a dispersione. A differenza del salvataggio di una tabella di correlazioni da Analizza > Metodi multivariati > Multivariato, questo componente aggiuntivo produce correlazioni solo per le colonne Y specificate rispetto alle colonne X specificate (anziché tutte le Y l'una contro l'altra).
Opzioni:
- Salva le immagini del grafico a dispersione nella tabella (attivata per impostazione predefinita - richiede JMP 12): salva le immagini di ciascun grafico a dispersione, inclusa l'ellisse di densità, nella tabella dati come colonna di espressione. Nota: questo può richiedere molto tempo per un gran numero di variabili.
- Correlazioni non parametriche (attivata per impostazione predefinita): salva le correlazioni non parametriche e i valori p nella tabella (Spearman ρ, Kendall τ, Hoeffding D).
- False Discovery Rate Correction (attiva per impostazione predefinita): applica l'aggiustamento Benjamini-Hochberg ai valori p (inclusi i valori p non parametrici se richiesti)
- Color Cells by Correlation (attivo per impostazione predefinita): colora le singole celle in base al valore della correlazione.
- Ordinamento (disattivato per impostazione predefinita): se viene selezionata un'opzione di ordinamento, la tabella dei dati risultante verrà automaticamente ordinata in base alla correlazione di Pearson (discendente) o al valore p (ascendente).
Dialogo Specifica Y e X numerici | Tabella dati con Immagini del grafico a dispersione e Script Heatmap salvato | Mappa termica con Passaggio del mouse sul grafico a dispersione |
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Visualizzazione datiUtilitàRi: correla Y con il componente aggiuntivo XCiao Giuliano,
Poiché questo fornisce i valori/le probabilità di correlazione di Pearson nelle colonne, mi piacerebbe anche vedere questo componente aggiuntivo aggiornato per le versioni correnti di JMP (sto usando 16.0.0 e il plug-in non funziona!).
Ringraziamenti sinceri!
Ri: correla Y con il componente aggiuntivo XCiao Giuliano,
Il componente aggiuntivo non funziona come prima. Aveva molte fantastiche funzionalità che non erano incluse nello screening della risposta come correlazioni non parametriche e valori p (Spearman ρ, Kendall τ, Hoeffding D) e il grafico a dispersione. Pensi che queste funzionalità possano tornare in questo componente aggiuntivo?
Grazie!
Ri: correla Y con il componente aggiuntivo XCiao, quando si esegue il componente aggiuntivo in JMPGenomics, la maggior parte delle finestre dei risultati si apre (penso 2 o 3) e si chiude immediatamente automaticamente. Anche nella tabella con le correlazioni non riesco ad aprire gli scatterplot salvati e le correlazioni non sono colorate per valore. Sto usando Windows 10. Quali sono i requisiti per l'esecuzione di questo strumento.Ri: correla Y con il componente aggiuntivo X<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Beh, non va bene! Funziona sulla mia istanza di JMP 12 sul mio Mac, ma lo proverò su altre macchine per vedere se riesco a rintracciare cosa sta succedendo. Grazie per avermi fatto sapere!
Ri: correla Y con il componente aggiuntivo XSceneggiatura divertente, la proverò su un progetto di dati storici. Solo una nota, quando ho eseguito su JMP12 (mac) i colori non sono stati salvati automaticamente nella mia tabella né lo script per la mappa termica.
