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Biom-Importeur

Beschreibung

Dieses Add-In dient zum Lesen und Konvertieren von Biom-Dateien in JMP-Tabellen (OTU-Tabelle) und zur Unterstützung der nachfolgenden Metagenomik-Analyse. Es unterstützt derzeit nur die neueste Version des Biom-Formats: Version 2.1. Biom-Dateien im Binärformat werden nicht unterstützt.

 

Anwendungsbeispiel

1. Gehen Sie nach der Installation dieses Add-Ins zu " Add-Ins " aus der Symbolleiste von JMP oder JMP Genomics. Klicken " Biom-Importeur " aus dem Dropdown-Menü, um das Programm zu starten.
2. Unter " Biom-Datei auswählen: " Abschnitt, klicken Sie auf " Wählen ", um durch Ihren lokalen Computer zu navigieren und Ihre Eingabe-Biom-Datei zu finden. Sie können die Verzeichnisadresse auch in das Textfeld kopieren. Klicken " Zurücksetzen „Wenn du von vorne anfangen willst.
3. Ebenso unter „ Ausgabeordner auswählen: ", wählen " Wählen ", um den Ausgabeordner festzulegen oder die Adresse in das Textfeld zu kopieren. Hinweis: Wenn Sie den Ausgabeordner nicht auswählen, werden die Ausgabetabellen weiterhin geöffnet, können aber nicht gespeichert werden

     

4. Klicken " OK ", um Ihre Eingabedatei in eine JMP-Tabelle (OTU-Tabelle) zu konvertieren. Wenn Ihre Eingabedatei Probeninformationen enthält, wird auch eine zweite Probentabelle erstellt.

    

    

OTU-Tabelle:

 

 

 

Beispieltabelle:

Gespeicherte Dateien:

 

 

Nutzungshinweise:

• Wenn Sie sich Ihre Rohdaten vor der Konvertierung ansehen oder die Ausgabetabelle mit der ursprünglichen Biom-Datei vergleichen möchten, klicken Sie auf " Vorschau ", um die ausgewählte Eingabedatei zu öffnen.
• Klicken " ? " oder " Hilfe " finden Sie Tipps und weitere Informationen zu diesem Programm.
• Hinterlassen Sie einen Kommentar oder wenden Sie sich an das Team von JMP Life Science, wenn Sie Fragen oder Anregungen haben!

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