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Importateur de biomes

Description

Ce complément sert à lire et à convertir les fichiers Biom en tables JMP (table OTU) et à faciliter l'analyse métagénomique ultérieure. Il ne prend actuellement en charge que la dernière version du format Biom : Version 2.1. Les fichiers Biom au format binaire ne sont pas pris en charge.

Exemple d'utilisation

Après avoir installé ce complément, accédez à " Compléments " dans la barre d'outils de JMP ou JMP Genomics. Cliquez sur " Importateur de biomes " dans le menu déroulant pour lancer le programme.
Sous " Sélectionnez le fichier Biom : " Rubrique, cliquez " Choisir " pour naviguer dans votre machine locale pour trouver votre fichier Biom d'entrée. Vous pouvez également copier l'adresse du répertoire dans la zone de texte. Cliquez sur " Réinitialiser " si vous voulez recommencer.
De même, sous " Sélectionnez le dossier de sortie : ", sélectionner " Choisir " pour définir le dossier de sortie ou copier l'adresse dans la zone de texte. Remarque : si vous ne sélectionnez pas le dossier de sortie, les tables de sortie seront toujours ouvertes mais ne pourront pas être enregistrées
Cliquez sur " D'ACCORD " pour convertir votre fichier d'entrée en table JMP (table OTU). Si votre fichier d'entrée contient des informations d'échantillon, une deuxième table d'échantillon sera également créée.

Tableau OTU :

Exemple de tableau :

Fichiers enregistrés :

Remarques d'utilisation :

Si vous souhaitez consulter vos données brutes avant de procéder à la conversion ou si vous souhaitez comparer le tableau de sortie au fichier Biom d'origine, cliquez sur " Aperçu " pour ouvrir le fichier d'entrée sélectionné.
Cliquez sur " ? " ou " Aider " pour trouver des conseils et plus d'informations sur ce programme.
Laissez un commentaire ou contactez l'équipe JMP Life Science si vous avez des questions ou des suggestions !