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Importatore di biom

Descrizione

Questo componente aggiuntivo serve per leggere e convertire i file Biom in tabelle JMP (tabella OTU) e per facilitare la successiva analisi di metagenomica. Attualmente supporta solo l'ultima versione del formato Biom: la versione 2.1. I file biom in formato binario non sono supportati.

Esempio di utilizzo

Dopo aver installato questo componente aggiuntivo, vai a " Componenti aggiuntivi " dalla barra degli strumenti di JMP o JMP Genomics. Fare clic su " Importatore di biom " dal menu a discesa per avviare il programma.
Sotto " Seleziona file biom: "sezione, fare clic su" Scegliere " per navigare nel computer locale per trovare il file Biom di input. Puoi anche copiare l'indirizzo della directory nella casella di testo. Fare clic su " Ripristina "se vuoi ricominciare.
Allo stesso modo, sotto " Seleziona la cartella di output: ", Selezionare " Scegliere " per impostare la cartella di output o copiare l'indirizzo nella casella di testo. Nota: se non si seleziona la cartella di output, le tabelle di output verranno comunque aperte ma non potranno essere salvate
Fare clic su " OK " per convertire il file di input in una tabella JMP (tabella OTU). Se il file di input contiene informazioni di esempio, verrà creata anche una seconda tabella di esempio.

Tabella OTU:

Tabella di esempio:

File salvati:

Note sull'uso:

Se vuoi dare un'occhiata ai tuoi dati grezzi prima di eseguire la conversione o vuoi confrontare la tabella di output con il file Biom originale, fai clic su " Anteprima " per aprire il file di input selezionato.
Fare clic su " ? " O " Aiuto " per trovare suggerimenti e ulteriori informazioni su questo programma.
Lascia un commento o contatta il team JMP Life Science se hai domande o suggerimenti!