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liliconcom

Importador de biomas

Descripción

Este complemento es para leer y convertir archivos Biom en tablas JMP (tabla OTU) y para ayudar en el análisis metagenómico posterior. Actualmente solo es compatible con la última versión del formato Biom: Versión 2.1. Los archivos Biom en formato binario no son compatibles.

Ejemplo de uso

Después de instalar este complemento, vaya a " Complementos " desde la barra de herramientas de JMP o JMP Genomics. Haga clic en " Importador de biomas " en el menú desplegable para iniciar el programa.
Bajo " Seleccionar archivo biom: " sección, haga clic en " Elegir " para navegar a través de su máquina local para encontrar su archivo Biom de entrada. También puede copiar la dirección del directorio en el cuadro de texto. Haga clic en " Reiniciar "Si quieres empezar de nuevo.
Del mismo modo, bajo " Seleccione la carpeta de salida: ", seleccionar " Elegir " para configurar la carpeta de salida o copiar la dirección en el cuadro de texto. Nota: si no selecciona la carpeta de salida, las tablas de salida seguirán abiertas pero no se podrán guardar
Haga clic en " DE ACUERDO " para convertir su archivo de entrada a una tabla JMP (tabla OTU). Si su archivo de entrada contiene información de muestra, también se creará una segunda tabla de muestra.

tabla OTU:

Tabla de muestra:

Archivos guardados:

Notas de uso:

Si desea echar un vistazo a sus datos sin procesar antes de realizar la conversión o si desea comparar la tabla de salida con el archivo Biom original, haga clic en " Avance " para abrir el archivo de entrada seleccionado.
Haga clic en " ? " o " Ayuda " para encontrar consejos y más información sobre este programa.
¡Deje un comentario o comuníquese con el equipo de JMP Life Science si tiene alguna pregunta o sugerencia!