Re：Outcross Linkage Map分析JMP®基因組學的插件
OneMap軟件包中的更新（從版本2.1.0開始）在某些R函數（函數名稱和一些內部例程）中有效，並且它們將導致JMP基因組學的Outcross加載項中的錯誤，最高版本為9.0。JMP Genomics中已經進行了必要的修復，使Outcross Add-In與OneMap 2.1.0和2.1.1版本兼容（4月9日CRAN中提供的最新OneMap版本） 日 ，2018年）。這些修復程序將在JMP Genomics的下一版本中提供。同時，請聯繫技術支持團隊，在OneMap 2.1.0或更高版本中查詢此問題的幫助。或者，您可以從存檔中安裝OneMap 2.0.4或更早版本 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/onemap/ 。為方便起見，可以在此網頁上下載適用於Windows系統的OneMap_2.0.4.zip。
Re：Outcross Linkage Map分析JMP®基因組學的插件<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />JMP Genomics 7.1版本的新版本具有為改進軟件功能而量身定制的新功能：
- Linkage Group和Recombination流程有一個新選項，用於形成鏈接組，Transitive Grouping方法，以及設置R軟件內存使用的新選項。
- 聯動地圖訂單流程有兩個新的訂單標記選項，即地圖訂單優化和加速地圖訂單優化。前者使用SAS PROC OPTMODEL，後者使用SAS PROC OPTNET，兩者都是強大而快速的優化方法，適用於處理許多標記的排序。此外，還提供了一種新的標記順序隨機選項，可用於通過對連鎖組上的附近標記進行混洗來改善標記的整體排序。
跨鏈圖分析了JMP®基因組學的外接程序- “跨界鏈接圖分析”加載項提供了三個過程，以對源自兩個近親父母的雜交的全同胞家庭進行鏈接分析。這些過程是``鏈接組和重組''，``鏈接映射順序''和``構建QTL基因型概率數據集''，所有這些過程均在JMP，SAS和R的接口上運行。此加載項使用OneMap（Margarido等。2007，Hereditas 144：78-79）R包。
- 此外接程序已構建為可與R版本3.6.3或4.0.0和OneMap版本2.1.3一起使用。其他版本的R和OneMap可能無法正常工作。 OneMap軟件包（從2.1.3版開始）中的更新對某些R函數（函數名稱和某些內部例程）有影響，並且這些更新會在10.0版之前的JMP Genomics的Outcross加載項中引起錯誤。JMP Genomics已進行必要的修復，以使Outcross加載項與版本OneMap 2.1.3兼容（3月31日CRAN中提供了最新的OneMap版本）。 （2020年）。這些修復程序將在JMP Genomics 10.0版中提供。
- 網頁上有使用說明http://www.jmp.com/support/notes/52/744.html ，用戶可以在其中找到安裝說明的鏈接。
- JMP Genomics的較新版本10.0具有為提高軟件功能而量身定制的新功能：
- 鏈接組和重組過程具有形成鏈接組的新選項，傳遞組方法以及設置R軟件內存使用情況的新選項。
- 鏈接地圖訂單流程有兩個用於標記的新選項：地圖訂單優化和加速地圖訂單優化。前者使用SAS PROC OPTMODEL，後者使用SAS PROC OPTNET，這兩種方法都是功能強大且快速的優化方法，適合處理許多標記的排序。此外，還提供了一種新的選項，可以重新排列標記順序，該選項可以通過重新排列鏈接組上附近的標記來改善標記的整體順序。
生命科學
