Genomic Bayesian Methods Add-in은 베이지안 일반화 선형 회귀 (BGLR; de los Campos and Rodriguez 2014, Genetics 198 : 483-495)를 둘러싼 래퍼입니다. 유전 적 마커 효과는 Bayes A, Bayes B, Bayes C, Bayesian LASSO 또는 Bayesian Ridge Regression을 사용하여 추정 할 수 있습니다. 이 추가 기능의 방법은 JMP Genomics의 교차 검증 모델 비교 도구와 완전히 통합되어 여러 고유 모델의 정확도를 비교할 수 있습니다. 또한, 적합 모델의 마커 효과는 점수 파일에 저장되어 JMP Genomics의 교차 평가 및 자손 선택 육종 도구에로드되어 개인의 육종 값을 예측하고, 교배를 평가하고, 여러 세대의 육종에서 자손을 시뮬레이션 할 수 있습니다. .
아래 그림은 보리 데이터 세트에 맞는 Bayes B 방법을 보여줍니다. 예측 된 특성 값과 관찰 된 특성 값 간의 상관 관계는 0.8777입니다.
아래 그림은 6 회 반복에 대한 3 중 교차 검증을 통해 얻은 예측 및 관찰 된 특성 값 간의 상관 관계 평균을 보여줍니다. 따라서 플롯에 표시된 상관 관계는 테스트 된 각 모델에 대해 18 번 실행 한 평균입니다. 교차 검증 실행에서 Bayes B의 평균 상관 관계는 0.5357이지만 교차 검증없이 전체 데이터 세트에서 Bayes B의 상관 관계는 0.8777입니다 (첫 번째 그림에 표시됨). 이 예는 예측 정확도를보다 현실적으로 측정하기 위해 교차 검증을 통한 모델 비교의 중요성을 보여줍니다.
