使用管家基因进行批量效应调整您好，从带有计数数据的txt文件开始，我正在分析来自三个不同独立实验的RNAseq数据，这些实验应合并为单个分析。样本特征（例如疾病状况）在批次内完全混淆。管家基因的使用，例如Eisenberg等人提出的那些基因。（ http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2013.05.010 ），可能是解决批量效应的一种方法。JMP Genomics中是否有一种方法可以指定可用于调整批次的基因组？
非常感谢您的参与。
Re：使用管家基因调整批次效果嗨，
在JMP Genomics中，您可以在Expression> Normalization中使用Loess Normalization来指定用于标准化的控制集或管家基因集。 请参阅此处的文档
http://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=PA_G_EX_0342.html
希望这可以帮助，
克里斯
