带有SpectrumData的PCA<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />你好，
我想用基于光谱的数据进行PCA分析。PCA工作正常，我也收到了不错的结果。问题是我的装载图完全过度拥挤，因为我有大约3500个变量。将加载图显示为光谱而不是矢量会更好（在这种情况下，加载图中的x轴应表示波数，y轴表示一个PCA上的加载）。
我的数据排序如下表所示，区别在于我有超过5个变量和超过3个样本;-)
| 标题/ 波长 | 100 | 101 | 102 | 103 | 104 ..... |
|---|
| 样品A. | | | | | |
| 样品B. | | | | | |
| 样本C. | | | | | |
如果用质谱也可以做到这一点会更好。在这种情况下，如果数据可以在m / z @某个时间后排序，那将是非常好的。这样就可以将2个信息组合在一起。如果可能的话。M / z在一列中，时间在另一列中（在原始数据中）。
问候！
Re：带有SpectrumData的PCAMarcokunzelmann0，
我会提出你可以通过偏最小二乘分析得到更好的东西。 这种类型的分析似乎与光谱数据非常吻合。 您可以通过以下链接了解有关如何使用偏最小二乘法的更多信息。
有一本相关的书籍提供了一个非常好的例子，说明如何分析近红外光谱，然后预测辛烷值。
使用JMP发现偏最小二乘| JMP
