JMP基因组学如何在多位置实验中拟合QK矩阵<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />嗨，
我正在使用JMP Genomics对大约400个品种进行多地点实验建模。MAF = 0.05，大约10.000个SNP被保留。没有考虑品种间相关性的分析似乎没问题。但是，我知道其中一些品种是相关的。我想在建模中考虑到这一点。特别是，当我跨地点进行分析时，即在同时分析所有位置时，我想包括QK矩阵。
如果已经有一个描述这个的教程，我很乐意为它提供建议。但是，如果情况并非如此，我会很感激对我的问题的反馈。
谢谢
雅恩
回复：JMP基因组学如何在多位置实验中拟合QK矩阵嗨Jahn，
好问题。 这有点复杂，所以我建议发电子邮件 support@jmp.com 打开技术支持跟踪，以便我们进一步讨论细节。 一般的想法是你的Q和K矩阵将由为每个位置重复的相同块组成。 您可以使用完整数据集并一次估算Q和K，或者您可以在单个位置估算它们，然后手动复制它们以获得其他位置（更高效）。
希望有点帮助。
谢谢，
亚当
