多重假设检验<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />大家好，
我很快就需要进行大量的假设检验。因为众所周知，在这种情况下依赖p值是错误的，由于I类错误，我想使用错误发现率，更准确地说是积极的错误发现率（Storey），并且计算q值作为我的“调整后的p值”。
我的问题分为两个：
1。是否有任何代码来计算JMP 9中的pFDR和相应的q值？我在互联网上看到了一些东西，我认为这些功能已经存在于JMP Clinical中。我只有JMP 9的许可证，我不知道JMP的临床费用是多少，或者我是否有任何预算。因此，如果某处有一个简单的JSL代码，它对我来说非常有用。
2。如果存在这样的代码，则很可能需要p值向量作为输出。考虑到我有一个带有1个分类变量和500个连续变量的JMP文件，我想为500中的每一个运行一个t检验，并在一个新文件中保存一个p值的变量，包含其中500个。我如何在JSL中做到这一点？有可能吗？JMP将自动运行500次测试并仅保存p值？
先感谢您....
多重假设检验感谢大家的帮助。
周末过后，我将尝试使用代码并阅读幻灯片。
感谢Dave的链接，它看起来就像我需要的那样，谢谢大家的帮助，我很感激！
多重假设检验这些幻灯片中有很多好的信息。谢谢你分享戴夫。
多重假设检验以下是一些解释如何操作的幻灯片使用JSL连接到R
多重假设检验对于矩阵||是一个水平连接运算符。Concat（m，owr ......）是等价的。
我没有FDR的经验，但我在JMP-R情感方面做了一些尝试。以下是一个例子。前半部分与上面的例子相同。输出显示在jmp日志中。要将输出作为字符串输入，请将R Submit放入Log Capture（）函数中。
DT = 打开 （ “$ ENGLISH_SAMPLE_DATA / Big Class.jmp” ） ;
米 = [] ;
对于 （ 一世 = 4 ，一世 <= N Col （ DT ） ，一世 ++，
流 = 单程 （ ÿ （ 柱 （ 一世 ） ） ， X （ ： 性别 ） ， t测试 （ 1 ） ，无形 ） ;
OWR = 报告 （ 流 ） ;
米 = 米 || OWR [ “t测试” ] [ 数字Col Box （ 4 ）] [ 1 ] ;
） ;
DTP = 新表 （ “t检验” ，新栏目 （ “P” ，数字 ，设定值 （ 米 ） ） ） ;
VARNAME = “P” ;
R初始 （） ; //初始化R连接
R发送 （ DTP ） ; //将数据表发送给R.
//使用R命令提交字符串
R提交 （ “数据< - dtp
名称（数据）
连接（数据）
意思（” || VARNAME || “）” ） ;
R项 （） ;
多重假设检验谢谢，这是一个好主意......
还有一件事我需要完成它（接受我的道歉，因为我太忙了，我没有时间真正学习JSL ......）。从你的代码中我得到一个包含1列p值的JMP表，对吧？我现在应该编写一个连接到R的JSL代码，如果是这样，我需要一点指导，或者，如果我导出表并直接从R工作，它应该可以工作，不是吗？
如果有人能给我写一个快速简单的例子，说明如何在重新启动新表之后，连接到R并运行像mean（p）这样简单的东西，我可以稍后为pFDR修改它。
和最后一个问题（承诺），在行：
米 = 米 || OWR [ “t测试” ] [ 数字Col Box （ 4 ）] [ 1 ] ;
为什么要么 owr [...]？我的意思是，为什么||需要吗？
万分感谢，你节省了我很多时间将大数据集导出到R并在那里编码....
多重假设检验1。我不知道可以自由使用的JMP代码，但R中有几个选项。 http://strimmerlab.org/notes/fdr.html 列出了一些与FDR相关的包。JMP 9可以连接到R并从中检索结果。这可能比从头开始编写JSL中的算法要简单得多。
2。那应该是可能的。下面是一个可能会给你一些想法的例子。它通过以单向拟合循环遍历固定x列右侧的所有数字y列并从报告中检索p值（双侧t检验）并将其插入矩阵来工作。矩阵最终被添加到新数据表中的列中。
DT = 打开 （ “$ ENGLISH_SAMPLE_DATA / Big Class.jmp” ） ;
米 = [] ;
对于 （ 一世 = 4 ，一世 <= N Col （ DT ） ，一世 ++，
流 = 单程 （ ÿ （ 柱 （ 一世 ） ） ， X （ ： 性别 ） ， t测试 （ 1 ） ，无形 ） ;
OWR = 报告 （ 流 ） ;
米 = 米 || OWR [ “t测试” ] [ 数字Col Box （ 4 ）] [ 1 ] ;
） ;
新表 （ “t检验” ，新栏目 （ “P” ，数字 ，设定值 （ 米 ） ） ） ;
多重假设检验我认为pFDR存在于JMP Genomics中，但不存在于标准（或Pro）JMP中
