<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />为什么JMP基因组学仅通过具有随机,修复和协方差效应的序数性质计算20000个标记而不是40000个标记(Proc Grimmix)。
亲爱的道格
感谢快速回复。我认为我的设置文件没问题。我发给你一些SAS日志文件,它只计算30000个标记而不是300个样本的48909个标记。我认为这可能是我的电脑内存不足的问题。
我可以使用来自我的计算机的JMP基因组和来自其他更大服务器的SAS。
这里以日志文件的一些剪切为例。
注意:从数据集WORK.TEMP1中读取了48909个观测值。
注意:数据集WORK.TEMP有48909个观测值和3个变量。
注意:使用过程PSMOOTH(总处理时间):
实时0.03秒
cpu时间0.04秒
警告:参数2到宏功能%SUBSTR超出范围。
警告:参数3到宏功能%SUBSTR超出范围。
注意:从数据集WORK.TEMP1中读取了48909个观测值。
注意:从数据集WORK.TEMP中读取了48909个观测值。
注意:数据集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM具有48909个观测值和29个变量。
注意:使用的DATA语句(总处理时间):
实时0.04秒
cpu时间0.04秒
警告:%SYSFUNC或%QSYSFUNC宏函数引用的函数LOG10的参数
超出范围。
注意:在%SYSFUNC函数执行期间无法执行数学运算。该
操作结果已设置为缺失值。
注意:由于对缺失值执行操作而生成缺失值
在%SYSEVALF表达式评估期间。
注意:从数据集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM读取了48909个观测值。
注意:数据集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM具有48909个观测值和28个变量。
注意:使用的DATA语句(总处理时间):
实时0.03秒
cpu时间0.03秒
最好,
Siriluck
冯:道格
Gesendet:2014年10月13日星期一下午4:38
An:Wimmers,Siriluck
Betreff:Re: - 为什么JMP基因组计算只有20000个标记而不是40000个标记,具有随机,修复和协方差效应的序数特征(Proc Grimmix)。
JMP用户社区<>
为什么JMP基因组学仅通过具有随机,修复和协方差效应的序数性质计算20000个标记而不是40000个标记(Proc Grimmix)。
Doug Robinson的回复<>在讨论中 - 查看完整讨论<>
我想我们需要更多关于此的信息。有错误吗?我们最初的猜测是标记的类型被检查为“等位基因”,而实际上它是基因型或非定界基因型(数据表中每个标记的单个列中都表示了两个等位基因)。如果您可以发送设置文件,那将有所帮助。