生存分析:自動模型優化你好,我有興趣用基因表達數據進行生存分析。輸入將是來自一組基因的表達數據,並且我想要識別具有最佳模型性能的基因組(子集)。JMP(或JMP Genomics)能否自動識別最佳模型?
Re:生存分析:自動模型優化 @如 ,看起來你上面的回復出現亂碼。
你能再試一次嗎?
Re:生存分析:自動模型優化
<meta charset="“UTF-8”/" />
Re:生存分析:自動模型優化我想我首先要問的一個問題是,你如何確定“最佳”模型?在JMP Pro和JMP Genomics中都有驗證方法來幫助識別“最佳”模型(AICc,BIC,驗證欄,交叉驗證等)。然後有適合的統計數據,也有助於確定最佳表現模型方法。
如前所述,給定為感興趣的模型選擇的驗證方法,JMP Pro在自動模型選擇(用於模型的預測變量的數量)方面做得相當不錯。還需要比較建模方法以及模型本身。 JMP Pro和JMP Genomics都提供模型比較工具來評估這一點。
最後,人們仍然應該在使用之前探索基因是什麼以及模型的樣子。建模是一個探索性過程,不應該完全“自動化”。
有關Predictive Modeling的JMP Genomics信息可在此處找到:
https://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=predictive_modeling.11.01.html
查看Buckley-James估算方法,該方法允許人們使用其他建模方法(如嶺回歸等)與查看器的時間到事件數據。
克里斯
Re:生存分析:自動模型優化你好,
在JMP Pro 13中,您可以使用擬合模型中的廣義回歸個性來使用現代變量選擇技術(例如Lasso和Elastic Net)以及前向選擇來執行生存分析。
希望有所幫助,
邁克爾