Re:Add-Ins outcross mapping或者,您可以从存档中安装OneMap 2.0.4或更早版本 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/onemap/ 。此版本与JMP Genomics 9.0及更早版本中的Outcross Add-In兼容。为方便起见,我正在为Windows系统附加OneMap_2.0.4.zip。
Re:Add-Ins outcross mapping错误:R:rf.2pts出错(outcross.obj,LOD = NULL,max.rf = NULL,详细= FALSE)
错误:R:找不到功能“rf.2pts”
上面显示的错误消息是由于OneMap软件包中的更新(从版本2.1.0开始)。这些更新在某些R函数(函数名称和一些内部例程)中有效,并且它们将导致JMP基因组学的Outcross加载项中的错误,最高版本为9.0。JMP Genomics中已经进行了必要的修复,使Outcross Add-In与OneMap 2.1.0和2.1.1版本兼容(4月9日CRAN中提供的最新OneMap版本) 日 ,2018年)。这些修复程序将在JMP Genomics的下一版本中提供。同时,请联系技术支持团队以咨询有关此问题的帮助。
Re:Add-Ins outcross mapping嗨萨利赫,
我相信JMP Genomics的开发人员之一可能通过直接向您发送电子邮件来回答您的问题。这是评论,所以其他可能发现自己具有相同情况的人也可以得到答案。
Plesae确保安装了OneMap R软件包并重新启动JMP Genomics。
如果您仍然收到错误消息,请告诉我们。
克里斯
Re:Add-Ins outcross mapping亲爱的克里斯,
谢谢。
它工作,我没有得到RLANG错误消息。
但是,当我尝试运行重组时,我收到以下错误消息
和加载项下的连锁群分析:异交连锁图分析。一世
使用默认样本文件(simuf1)来运行重组和链接组
分析。
在进程LinkageGroupOutcross中发生以下错误
错误:R:rf.2pts出错(outcross.obj,LOD = NULL,max.rf = NULL,详细
= FALSE):
错误:R:找不到功能“rf.2pts”
错误:R:get.2pts.analysis(twopts.obj)中的错误:对象'twopts.obj'没有
发现
错误:R:eval中的错误(expr,p):找不到对象'rfmat.obj'
错误:R:调用:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
请你写一下收到错误信息的原因。
我还使用默认文件运行链接映射顺序
在进程LinkageMapOrderOutcross中发生以下错误
错误:R:make.seq中出错(twopts.obj,“all”):找不到函数
“make.seq”
错误:R:eval中的错误(expr,p):找不到对象'mappedm.final'
错误:R:调用:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
请你写一下收到错误信息的原因。
*我也运行QTL分析,没有收到任何错误信息。*
Re:Add-Ins outcross mapping嗨萨利赫,
我收到了一些发展评论。试试这个:
- 完全关闭JMP Genomics并确保JMP和SAS未在后台运行(使用任务管理器查找)
- 重新启动计算机以确保现在可以识别可能已由R安装添加的任何注册表或系统变量
- 打开SAS会话(“开始”>“SAS”>“SAS 9.4”),然后在“编辑器”窗口中键入以下内容:
- proc options option = RLANG;
跑;
- 单击工具栏顶部看起来像跑步者的按钮
- 签入日志,它应该在日志窗口中返回一条消息
- 如果它返回:
- “NORLANG 不支持访问R语言接口“,您无权从SAS系统调用R。
- “RLANG 支持访问R语言接口“,您可以从SAS系统调用R. 检查你的R_Home Environtment。看到这个链接:
https://stackoverflow.com/questions/19525903/editing-sas-config-files-to-execute-r-making-sas-play-well-with-others
如果您还有问题,请告诉我。
克里斯
回复:外接程序跨站映射萨利赫,你好
您在编辑完JMP Genomics之后是否重新启动了sasv9.cfg文件? 您必须关闭JMP Genomics并将其重新打开才能使编辑生效。
请回到我身边,以便我们制定解决方案。
谢谢,
卢西亚诺
外接程序外接映射我在JMP Genomics软件的加载项中安装了交叉链接图分析。 我还在C:\ Program Files \ SASHome \ SASFoundation \ 9.4 \ nls \ en \ sasv9.cfg下的sasv9.cfg文件的第一行中也写了-RLANG。 但是,当我运行链接分析时,仍然出现以下错误消息。
我需要你的经验。
最好的祝愿
萨利赫
错误:必须在SAS配置文件或SAS调用命令行中指定RLANG系统选项,才能启用
提交R语言声明。
16632如果^ isOK然后执行;
其他