热图、行分组<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />大家好,
感谢您花时间阅读我的问题。
我将直接讨论 JMP 的问题:
我有 10 只小鼠的几个脂质组浓度数据条件A和 10 肉末条件B 。 每当我尝试生成聚类分析和颜色图时,JMP 都会保留重新排列我的行所以我的条件 A - 小鼠与我的条件 B - 小鼠混合在一起。
我只想要一个热图,其中 Y 轴上有我的 2 个组:条件 A 和条件 B。 每列都对应于一种脂质。
我可以使用 R 来执行此操作,但我真的很想使用 JMP,因为它执行起来非常快。
非常感谢您的帮助。
回复:热图,行分组嗨朱利安,
我是 JMP 新手。这个例子非常接近我想要做的事情。 我想查看图形生成器教程,但链接不起作用。
请帮忙。
回复:热图,行分组知道了! 然后我将不得不继续使用单元格图来绘制我的热图。 谢谢
回复:热图,行分组好问题! 尽管图形生成器通常更灵活,但只有一种颜色角色,因此您只能使用单个统一的比例,这与单元格图不同,单元格图允许您为每个变量使用单独的比例。
关于整理热图使用指南的好建议! 我会将其添加到我们将来制作的一页指南列表中。 如果您还没有看过当前的收藏,可以在 jmp.com/learn 上找到它们
朱利安
回复:热图,行分组我了解使用堆栈功能然后使用图形生成器的技巧。我使用你的方法得到的结果非常有希望,但我想知道如何不均匀缩放热图就像我可以使用单元格图一样(在本例中:每个时间点测量血压都有一个刻度)。
我感觉自己是 JMP 的初学者,但我也觉得到目前为止,我在帮助、可用的用户指南和 Youtube 教程方面做得还不错。 但在您回复之前我找不到任何有关制作这些热图的信息。 我认为 JMP 就此编写某种官方帮助非常有价值,因为热图现在非常流行。
回复:热图,行分组很高兴我能帮上忙!
如果它对以后有帮助,我想向您展示如何使用图形生成器制作相同的图(它更灵活,但需要我们进行一点点重组)。 这是该过程的快速视频(它很简单,但作为一系列步骤看起来比视频中更复杂)。
希望这对您将来有所帮助!
朱利安

回复:热图,行分组嗨朱利安,
这看起来正是我想要的!
非常感谢您的帮助。
我也希望它能帮助其他人。
小心,
托马斯
回复:热图,行分组你好托马斯,
我相信您可以通过将主题和剂量放在“标签”部分中来获得您想要的内容,而不是将剂量放在“X,分组”部分中。

为了获得统一的比例,请在单击“确定”之前选中“统一比例”框。

这更接近你想要的吗?
朱利安
回复:热图,行分组嗨朱利安,
非常感谢您的高度赞赏的回复。
血液样本压力数据集实际上与我的情况非常相似。 在此数据集中,假设我想要制作第 11 行到第 20 行数据的热图(2 个条件:对照/安慰剂)。 我想在同一个热图上2 个条件(因此前 5 行为对照,后 5 行为安慰剂),并且每列都是血压测量的条件,仅针对两种条件的一种独特的按列比例。
如果我没有说清楚,请告诉我。
祝你周日愉快。
回复:热图,行分组你好托马斯,
听起来你正在运行一个层次聚类分析,对吗? 对于该分析输出,行被重新排列以形成 d endrogram,所以我们需要做一些其他的事情来形成我认为你想要的图形。如果您希望保留行排序并显示脂质组学集中于A热图,也许图形 > 单元格图适合您。
这是一个使用 Big Class 示例数据集的简单示例:


这是一个使用血压样本数据集的更大示例,其中有 4 个水平的实验因子和 6 个 DV:


这接近您正在寻找的东西吗? 如果没有的话可以提供一下图片吗种类你想要制作什么情节? 我确信我们可以找到一种方法来使用 JMP 实现这一目标。
希望这可以帮助!
朱利安