概率分析 - 拟合检验（回归）和重复我正在尝试确定我在体外（在培养皿中）尝试过的某些杀菌剂与不同分离物的 ec50（与对照相比，有 50% 径向真菌生长的浓度）。 我用不同的杀菌剂测试了相同的 9 种不同的分离株作为放射状菌丝体的生长。 对于每种杀真菌剂，有 5、6 或 7（取决于杀真菌剂）浓度测试，每个浓度重复 3 次。 对于每种杀真菌剂，所有培养皿均在同一天测量。
概率 - 二项式分布似乎很好地拟合了数据，至少在大多数情况下是这样。
我的问题是如何在分析中包含重复以及如何确定标准误差。
附上数据截图。
datadata数据
fit modelfit model适合模特
regression plotregression plot回归图
ec 50ec 50EC 50
回复：概率分析 - 适合测试（回归）和复制所以我像上图一样设置了分析（下面的快速脚本来设置它）
Fit Model(
Y( :inhibition, :N ),
By( :isolate ),
Effects( :log ppm, :Replicate, :Replicate * :log ppm ),
Personality( "Generalized Linear Model" ),
GLM Distribution( "Binomial" ),
Link Function( "Logit" ),
Overdispersion Tests and Intervals( 0 ),
Name( "Firth Bias-Adjusted Estimates" )(0),
Run
)
按住控制键（OSx 上的命令键），同时单击最高级别的红色三角形，从菜单中选择反向预测。 然后对于弹出的每个对话框，输入 0.5 作为预测概率。 这需要一段时间，因为系统会提示您输入每个隔离级别。
完成后，右键单击其中一个分离株的逆向预测表之一，然后选择制作组合数据表。 该表是我在上面的示例中进行操作的表，因此我可以绘制图表并进行分析。
回复：概率分析 - 适合测试（回归）和复制我在拟合模型后使用红色三角形下的逆预测区间选项来获得拐点/ec50s
回复：概率分析 - 适合测试（回归）和复制谢谢。 你能告诉我你是如何计算平均值的吗？ 您是否将它们导出到表格并从那里准备图表？ 我似乎无法弄清楚。 先感谢您。
回复：概率分析 - 适合测试（回归）和复制在这种情况下，一组重复是在一起的。 这不是一个坏方法，因为它基本上符合均值复制，从而更好地适应响应模式。 请记住，重复不是独立的观测值（取决于实验单位），JMP 假设每一行都是独立的观测值。 如果数据是堆叠的（每个重复一列，每个分离物一行）
您可能还想尝试为每个分离株分别拟合每个复制。像这样：
请注意，您必须为每个分离物手动添加每个逆向预测。 （注意：超级乏味，所以请在 jmp dot com 上发送功能建议以支持）当您选择逆向预测选项时按住 CTRL，然后将出现用于计算每个隔离物的 0.5 概率的对话框。
在这种情况下，将计算隔离对每个复制的适合度。 错误不会为 replcates 合并。 这就像用独立的 sigma 估计做一个混合模型。
在下图中，“平均”水平与您在帖子中所做的一样，所有重复项都在一起。 注意置信区间的差异。
注意：JMP 14有区间作用，所以这个很容易制作。
所以要处理的问题是，如果表格像发布的文件一样采用高格式，则行中的重复项将被视为独立观察。 我将做出一个安全的假设，即它们不是独立的。 重复取决于实验单元。 所以这里是如何使用它。 另一种方法是像这样拆分表：
current Datatable() << Split(
Split By( :Replicate ),
Split( :inhibition ),
Group( :isolate, :ppm ),
Sort by Column Property
);
不确定哪个是最好的处理重复的方法，平均值还是几何平均值？
但无论哪种方式，很容易看出强制均值的置信区间（具有独立重复的 tall 格式的表。）比拆分表的均值区间窄很多。 这是因为通过将重复视为独立来扩大自由度。
此图的数据来自以不同方式拟合的数据的 EC50，它不是默认报告图。
