使用用户定义的方程创建距离矩阵你好,
我正在尝试为社区数据创建相似性/不相似性值的距离矩阵。我想使用一个特定的方程(Bray-Curtis)来构造值矩阵;值将显示多个地块之间多个物种丰度的相似性。我知道使用层次聚类在 JMP 中创建距离矩阵的方法,但不知道如何使用我自己的方程执行类似的命令。有没有一个工具可以做到这一点,或者我将如何编写脚本来做到这一点?
回复:使用用户定义的方程创建距离矩阵嗨,呵呵!
无论您想要什么,都可以通过脚本实现。JSL将让你自由!
至于如何编写脚本来执行此操作,我推荐使用计算机键盘。
不过,说实话,在开始编写脚本之前,您需要考虑几件事:数据源的结构和组织方式、必要的数据分析步骤、您想要的输出以及如何使用脚本。您可能需要编写一个函数来实现您选择的相异性度量。
根据您对这些问题的回答(JSL Companion 第二版的第 11 章中有一个有用的清单),编写脚本可能或多或少有些困难。
而且,如果您确实需要选择,我会推荐一种与 Bray-Curtis 不同的相异性度量。如果您愿意,请参考随附的文件。
祝你好运!