如何准备计算奇数比的数据？你好，
我有两组患者（连续变量）的大型基因组学数据库。 一组在某些观察点出现并发症，该组收集了 4 次重复测量的基因抑制。 对照组只收集了 3 个时间点。 我想知道某些基因在基线（第 0 周）的表达是否可以预测结果：并发症（编码是否）或死亡（编码 1 或 2）。 我如何准备数据进行分析，我选择什么模型？ 我需要比较每个子组的 LSmeans 吗？ 在此数据中，我在列上有基因，在行上有患者 ID。
Re: 如何准备计算奇数比的数据？在 JMP 中，您可以进行多级逻辑回归
https://community.jmp.com/t5/Discussions/Logistic-regression-with-multiple-outcome-variables/td-p/4901
但我会从两级聚合数据开始（看看会发生什么）：
1.并发症是（早期和晚期并发症）
2. 并发症 否
Re: 如何准备计算奇数比的数据？我有 3 种类型的角色变量或治疗并发症：1。 早期并发症，2。 晚期并发症和 3. 没有并发症。 因此，逻辑回归可能不起作用：我收到“无法收敛（步长减半限制）”错误。 两组的治疗类型相同。 有没有人使用偏最小二乘法来预测疾病结果的生物标志物？Re: 如何准备计算奇数比的数据？我们的大学没有订阅 JMP Genomics，但感谢您的文章。Re: 如何准备计算奇数比的数据？你好，
如果您有一个大型基因组学数据库，我假设您可能有 10,000 个基因，因此有 10,000 个列。如果是这样，您可能想看看 JMP Genomics：
https://www.jmp.com/en_us/software/jmp-genomics.html
此外，您可以通过以下方式查看类似的用例马修·J旺琴科，等人。他们研究了不同的治疗组和无进展生存期。 链接到下面的论文。
http://clincancerres.aacrjournals.org/content/early/2017/05/23/1078-0432.CCR-17-0172
如果您之前没有使用过 JMP Genomics，那么请观看这个简短的视频：
https://www.youtube.com/watch?v=DmaKz4NOURk
如果您想了解更多信息，请告诉我。
最好的，
克里斯·基希伯格
Re: 如何准备计算奇数比的数据？您可以从逻辑回归开始。 数据应包括具有并发症和死亡列的患者横截面（编码为 1/0 或 Y/N，建模类型设置为标称）、治疗/对照组指标（编码为 1/0）和基线和其他时间点的基因表达列，以及您可用的任何其他变量，例如患者人口统计数据。
然后，您可以对作为名义结果的并发症（和死亡）进行名义逻辑回归，并将这些列作为模型效应：治疗/对照、不同时间点的基因表达和其他变量。 您可能需要考虑诸如 Treatment/Comtrol*Gene Expression at Baseline 等交互作用。
关于逻辑回归的优势比的 JMP 文档
http://www.jmp.com/support/help/13/Odds_Ratios_Nominal_Responses_Only.shtml#65579
