如何分析具有两个区组因素的双因素方差分析我设计了一个随机完全区组实验，将重复的植物组种植在托盘中。托盘是区组因子，每个托盘内有24个单元格，我在每个单元格中种植了植物组。托盘的每个单元格中都有一株目标植物和一些相邻植物。目标植物可以是高株或矮株，相邻植物（统称为高株或矮株）也可以是高株或矮株。因此，处理1是目标植物的大小，处理2是相邻植物的大小。每个托盘中所有处理水平组合都出现了6次。在托盘层面，一些托盘全部种植的是特定基因型，而另一些托盘则种植的是不同的基因型（每个基因型重复2-4次）。所以我想知道，我是否必须分别处理所有基因型（一系列随机完全区组设计），或者我是否可以将它们放在一个总体分析中，其中“基因型”被视为区组因子，甚至是托盘层面的处理（而大小处理在托盘内是随机的）。响应变量是种子数量。我预期不同基因型的种子数量总体上会有所不同，但我对此并不感兴趣——我只对焦点/邻近大小的处理感兴趣。
如果有人能参考 Fit Model 平台（交互式解释）提供分析建议，我们将不胜感激！
消费者和市场研究数据探索与可视化实验设计大规模定制Re：如何用两个阻塞因子分析双向ANOVA我为您的案例更新了设计示例。
我对列进行了排序，以便分割图的性质很明显。（我假设您在整个图中随机化。）如果您已经完成实验，排序还应该使您更容易转移结果。我添加了一个分发表脚本，因此您可以交互式地探索设计以说服自己它是RCBD。
请记住，我每个基因型总共使用4个托盘，我包括5种基因型，但我不知道你实际包含的是什么。我将默认的Whole Plots数据列名称更改为Trays，以反映整个图表的显示方式。
您可以使用DOE对话表脚本返回我指定的自定义设计，并根据需要进行修改。此外，您可以使用Cols> Recode轻松地将我的标签（例如，G1）替换为实际的基因型名称。我指定模型包括所有双因素交互和所要求的三因素交互。
我希望这个案例是一个很好的学习经历（JMP，DOE），所以如果你遇到困难，请问一下。
Re：如何用两个阻塞因子分析双向ANOVA（请注意，我修改了我的答案，因为我错过了关于交互效果的问题的完整含义。）
是的，这是你描述的裂缝设计，据我所知。
是的，全因子设计支持交互模型，因此包括交叉项如下：种子数=截距+焦点植物+邻居植物+基因型+（焦点植物）*（邻居植物） +（焦点植物）*（基因型） +（邻居植物）*（基因型）+（焦点植物）*（邻居植物）*（基因型） +错误。
Re：如何用两个阻塞因子分析双向ANOVA感谢您的回复，这非常有帮助。为了澄清术语，那么：您是否会将设计称为分割图，其基因型作用于整个图层（托盘），两个植物尺寸因子作用于子图层（托盘内的细胞）？最后，对于相互作用项，我对焦点植物大小x邻居植物大小相互作用感兴趣，但是还需要考虑与基因型的相互作用（例如，基因型x焦点植物大小x邻近植物大小）。换句话说，这个设计的“完整模型”是什么？
Re：如何用两个阻塞因子分析双向ANOVA你的描述很清楚，但如果我出错了，请纠正我。在说我认为你应该一起分析所有数据之后，让我们澄清一些关于设计的重要观点，而不是分别针对每种基因型。
我认为基因型是一个难以改变因素，因为它没有随机化。它被复制了2-4次。这些运行组（托盘）是整个情节不是块 。你改变了两个容易改变每个整体图中的因素作为复制的全因子设计。
我想你有五种基因型并且总是进行四次重复（托盘）。如果使用的托盘少于四个，则可以删除行组。基因型是固定效应，整个图是随机效应。我附上了一个设计，以便您可以看到可能有用的内容以及如何使用它。我没有在模型中包含交互项，但数据支持估计这种效果。
