在JMPG中重新编码基因型产生不完整的输出数据集你好，
我试图将二倍体格式（例如A / G，G / C等）的基因型数据集（~40k SNP）重新编码为数字格式（0，同源; 1，hete; 2，同源）。重新编码看起来很好，问题是我的数据输出不完整（它只包含~29 k SNP）。我没有得到任何错误或按摩，表明我的其他标记发生了什么。
能不能给我解决这个问题的任何线索
我正在使用JMP Genomics 8.2
谢谢
回复：在JMPG中重新编码基因型产生不完整的输出数据集你好 @lfsamayo_ncsu_e ，
这很奇怪。我只是将来自AA，AB和BB的295988个SNP重新编码为0,1和2。 所有的SNP都在那里。我正在使用JMP Genomics 9.0。
给支持人员打电话或发送电子邮件至support@jmp.com，询问他们可能存在的问题。
最好，
克里斯
