折叠表P值和FDR用于比较组我有许多响应变量（~15K）和许多样本（~7K）的数据集。 我已经将基于先验知识的样本聚类到10个聚类中，并且需要定义每个聚类的特征变量。 我想生成一个表/矩阵，列出所有变量与集群的关系，平均响应值（每个集群与所有其他样本一起）的倍数变化（比率）与P值（校正与否）和FDR（如果可能） 。
希望有一种简单的方法来生成它。 ANOVA或负二项选项会有所帮助。
Re：用于比较组的倍数变化P值和FDR表我在这种病例中的经验是病毒学，当有用信息翻倍但反应是滴度。因此，转换可以使响应更有意义转换为Ln（titer）/ Ln（2）。（这实际上是对数基数2.）您可以使用列公式进行此转换，而无需单独的脚本。
Re：用于比较组的倍数变化P值和FDR表响应筛选给出了手段上的差异。 然而，就我们的目的而言，平均值的差异与每个gropup均值与整体的比率的差异并不相关。
因此需要具有P值和FDR的倍数变化表。我想知道他们是否可以使用这些脚本。
谢谢
Re：用于比较组的倍数变化P值和FDR表我建议你看一下筛选工具：分析>筛选>反应筛选。 我经常使用响应筛选平台来实现我认为你想要做的事情。 该文件位于：
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
