Correlación de diferentes tipos de datos¿Cómo podría correlacionar los valores de TC delta y la biomasa en gramos o el conteo de semillas en números aritméticos?
Re: Correlación de diferentes tipos de datos¿Puedes mostrar incluso algunas observaciones (filas) de datos? Difícil de imaginar su problema.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosAlgunas filas de datos adjuntos.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosSu respuesta no contiene ningún ejemplo en ninguna forma.
Además, por favor explique la naturaleza de las variables, Los valores de CT delta y la biomasa en gramos o conteo de semillas, y la intención de su análisis de correlación.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosAdjunté una hoja de cálculo de Excel que tenía mis datos en columnas. El valor CT es un an o unidad recibida de los resultados de qPCR que se utiliza para medir la expresión génica en una muestra de tejido vegetal. Por ejemplo, cuanto mayor sea el valor de CT, más copias del gen y mayor será la expresión. Lo que me preguntaron es si existe alguna correlación entre la expresión génica del tejido vegetal y la biomasa de la planta en los tratamientos dados. Lo mismo ocurre con la biomasa Ox + Myc + 4End + Bs del brote, la raíz, el peso de la semilla. y el conteo de semillas se correlaciona con el valor Agp CT del gen expresado por Ox + Myc + 4End + Bs, etc. Alguien sugirió que los valores de R cuadrado son lo que yo miraría pero eso no tiene sentido para mí.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosTodavía no veo ningún archivo adjunto a ninguna respuesta en este hilo de discusión.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosOk, vamos a intentar esto de nuevo:
Adjunté una hoja de cálculo de Excel que tenía mis datos en columnas. El valor CT es un an o unidad recibida de los resultados de qPCR que se utiliza para medir la expresión génica en una muestra de tejido vegetal. Por ejemplo, cuanto mayor sea el valor de CT, más copias del gen y mayor será la expresión. Lo que me preguntaron es si existe alguna correlación entre la expresión génica del tejido vegetal y la biomasa de la planta en los tratamientos dados. Lo mismo ocurre con la biomasa Ox + Myc + 4End + Bs del brote, la raíz, el peso de la semilla. y el conteo de semillas se correlaciona con el valor Agp CT del gen expresado por Ox + Myc + 4End + Bs, etc. Alguien sugirió que los valores de R cuadrado son lo que yo miraría pero eso no tiene sentido para mí.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosLos datos están en un libro de Excel. ¿Usas JMP?
Usé la regresión múltiple para evaluar la relación entre el peso seco del brote, el peso de la raíz seca, el peso de la semilla, Myc, 4End y Bs con las respuestas Agp shoot CT y Agp root CT por separado. Incluí términos cuadráticos para los factores cuantitativos porque mi análisis inicial indicó una no linealidad. No incluí ningún término para efectos potenciales de interacción.
El Agp Shoot CT muestra los efectos más fuertes. El factor Myc probablemente no sea significativo. El Profiler es la forma más fácil de interpretar el modelo.
Sólo hay una relación débil para el CT de la raíz de Agp. Parece que hay dos veces más variación en esta respuesta en comparación con la primera respuesta, pero mucho menos se correlaciona con los cambios en los factores. ¿Tiene sentido que la respuesta muestre un mínimo cerca del peso seco del brote medio?
Mis observaciones son:
- Este conjunto de datos es pequeño, por lo que hay poca potencia para detectar efectos activos.
- El experimento varió 6 factores en 10 ejecuciones, por lo que muchos efectos se confunden.
- O bien los niveles de factor Myc, 4End y Bs se registraron incorrectamente o este experimento no se diseñó utilizando principios estadísticos. Existen correlaciones innecesarias entre los factores que reducen la eficiencia de los datos para la estimación.
Re: Correlación de diferentes tipos de datosSí, yo uso JMP.
