Correlazione di diversi tipi di datiCome correlare i valori CT delta e la biomassa in grammi o conteggio seme in numeri aritmetici.
Re: correlazione di diversi tipi di datiPuoi mostrare anche alcune osservazioni (righe) di dati? Difficile da immaginare il tuo problema.
Re: correlazione di diversi tipi di datiPoche righe di dati allegate.
Re: correlazione di diversi tipi di datiLa tua risposta non contiene alcun esempio in alcun modo.
Inoltre, si prega di spiegare la natura delle variabili, valori CT delta e biomassa in grammi o numero di semi e l'intento della vostra analisi della correlazione.
Re: correlazione di diversi tipi di datiHo allegato un foglio di calcolo Excel con i miei dati in colonne. Il valore CT è un an o unità ricevuta dai risultati qPCR che viene utilizzata per misurare l'espressione genica in un campione di tessuto vegetale. Ad esempio più alto è il valore CT più copie del gene e maggiore è l'espressione. Quello che mi è stato chiesto è la correlazione tra l'espressione genica del tessuto vegetale e la biomassa della pianta ai trattamenti dati. Così fa Ox + Myc + 4End + Bs biomassa di germoglio, radice, seme wt. e il conteggio delle sementi è correlato con il valore di Agp CT del gene espresso da Ox + Myc + 4End + Bs e così via. Qualcuno ha suggerito che i valori del quadrato R sono ciò che guarderei ma che per me non ha senso.
Re: correlazione di diversi tipi di datiAncora non vedo alcun allegato a nessuna risposta in questa discussione.
Re: correlazione di diversi tipi di datiOk, provalo di nuovo:
Ho allegato un foglio di calcolo Excel con i miei dati in colonne. Il valore CT è un an o unità ricevuta dai risultati qPCR che viene utilizzata per misurare l'espressione genica in un campione di tessuto vegetale. Ad esempio più alto è il valore CT più copie del gene e maggiore è l'espressione. Quello che mi è stato chiesto è la correlazione tra l'espressione genica del tessuto vegetale e la biomassa della pianta ai trattamenti dati. Così fa Ox + Myc + 4End + Bs biomassa di germoglio, radice, seme wt. e il conteggio delle sementi è correlato con il valore di Agp CT del gene espresso da Ox + Myc + 4End + Bs e così via. Qualcuno ha suggerito che i valori del quadrato R sono ciò che guarderei ma che per me non ha senso.
Re: correlazione di diversi tipi di datiI dati sono in una cartella di lavoro di Excel. Usi JMP?
Ho usato regressione multipla per valutare la relazione tra il peso secco del germoglio, il peso secco delle radici, il peso del seme, Myc, 4End e Bs con le risposte Agp shoot CT e Agp root CT separatamente. Ho incluso termini quadratici per i fattori quantitativi perché la mia analisi iniziale indicava una non-linearità. Non ho incluso alcun termine per potenziali effetti di interazione.
L'Agp Shoot CT mostra gli effetti più forti. Il fattore Myc probabilmente non è significativo. Il Profiler è il modo più semplice per interpretare il modello.
C'è solo una relazione debole per l'Agp Root CT. Sembra esserci una variazione doppia di questa risposta rispetto alla prima risposta, ma molto meno di essa è correlata ai cambiamenti nei fattori. Ha senso che la risposta mostri un minimo vicino al peso medio del colpo secco?
Le mie osservazioni sono:
- Questo set di dati è piccolo, quindi c'è una bassa potenza per il rilevamento degli effetti attivi.
- L'esperimento ha variato 6 fattori su 10 esecuzioni, quindi molti effetti sono confusi.
- O i livelli del fattore Myc, 4End e Bs sono stati registrati in modo errato o questo esperimento non è stato progettato utilizzando principi statistici. Esistono correlazioni non necessarie tra i fattori che riducono l'efficienza dei dati per la stima.
Re: correlazione di diversi tipi di datiSì, io uso JMP.
