Korrelation verschiedener DatentypenWie könnte ich Delta-CT-Werte und Biomasse in Gramm oder Samenzahl in arithmetischen Zahlen korrelieren?
Re: Korrelation verschiedener DatentypenKönnen Sie auch einige Beobachtungen (Zeilen) von Daten zeigen? Schwer, sich Ihr Problem vorzustellen.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenEinige Datenzeilen angehängt.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenIhre Antwort enthält kein Beispiel in irgendeiner Form.
Bitte erläutern Sie auch die Art der Variablen. Delta-CT-Werte und Biomasse in Gramm oder Samenanzahl und die Absicht Ihrer Korrelationsanalyse.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenIch habe eine Excel-Tabelle angehängt, die meine Daten in Spalten hatte. Der CT-Wert ist ein an oder Einheit, die aus qPCR-Ergebnissen erhalten wurde und zur Messung der Genexpression in einer Gewebeprobe verwendet wird. Je höher beispielsweise der CT-Wert, desto mehr Kopien des Gens und desto höher die Expression. Ich wurde gefragt, ob es einen Zusammenhang zwischen der Genexpression des Pflanzengewebes und der Biomasse der Pflanze bei den gegebenen Behandlungen gibt. Ox + Myc + 4End + Bs-Biomasse aus Sproß, Wurzel, Samen und die Keimzahl korrelieren mit dem Agp-CT-Wert des durch Ox + Myc + 4End + Bs und so weiter exprimierten Gens. Jemand meinte, ich würde mir die R-Quadratwerte anschauen, aber das macht für mich keinen Sinn.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenIch sehe immer noch keinen Anhang zu einer Antwort in diesem Diskussionsthread.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenOk, lass es uns noch einmal versuchen:
Ich habe eine Excel-Tabelle angehängt, die meine Daten in Spalten hatte. Der CT-Wert ist ein an oder Einheit, die aus qPCR-Ergebnissen erhalten wurde und zur Messung der Genexpression in einer Gewebeprobe verwendet wird. Je höher beispielsweise der CT-Wert, desto mehr Kopien des Gens und desto höher die Expression. Ich wurde gefragt, ob es einen Zusammenhang zwischen der Genexpression des Pflanzengewebes und der Biomasse der Pflanze bei den gegebenen Behandlungen gibt. Ox + Myc + 4End + Bs-Biomasse aus Sproß, Wurzel, Samen und die Keimzahl korrelieren mit dem Agp-CT-Wert des durch Ox + Myc + 4End + Bs und so weiter exprimierten Gens. Jemand meinte, ich würde mir die R-Quadratwerte anschauen, aber das macht für mich keinen Sinn.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenDie Daten befinden sich in einer Excel-Arbeitsmappe. Verwenden Sie JMP?
Ich verwendete mehrfache Regression, um die Beziehung zwischen Spross-Trockengewicht, Wurzel-Trockengewicht, Samengewicht, Myc, 4End und Bs mit den Antworten Agp-Shoot-CT und Agp-Root-CT getrennt zu bewerten. Ich habe quadratische Ausdrücke für die quantitativen Faktoren einbezogen, weil meine anfängliche Analyse eine Nichtlinearität anzeigte. Ich habe keine Begriffe für mögliche Interaktionseffekte angegeben.
Die Agp Shoot CT zeigt die stärksten Effekte. Der Faktor Myc ist wahrscheinlich nicht signifikant. Der Profiler ist der einfachste Weg, um das Modell zu interpretieren.
Es gibt nur eine schwache Beziehung für das Agp Root CT. Diese Reaktion scheint im Vergleich zur ersten Reaktion doppelt so stark zu sein, aber viel weniger davon hängt mit den Änderungen der Faktoren zusammen. Ist es sinnvoll, dass die Reaktion nahe dem Trockengewicht des mittleren Triebs ein Minimum aufweist?
Meine Beobachtungen sind:
- Dieser Datensatz ist klein, so dass die Erkennung aktiver Effekte gering ist.
- Das Experiment variierte über 10 Läufe um 6 Faktoren, so dass viele Effekte verwechselt werden.
- Entweder wurden die Myc-, 4End- und Bs-Faktoren nicht korrekt erfasst oder dieses Experiment wurde nicht mit statistischen Prinzipien erstellt. Es gibt unnötige Korrelationen zwischen den Faktoren, die die Effizienz der Schätzdaten verringern.
Re: Korrelation verschiedener DatentypenJa, ich benutze JMP.
