Corrélation de différents types de donnéesComment pourrais-je corréler les valeurs de CT delta et la biomasse en grammes ou le nombre de graines en nombres arithmétiques.
Re: Corrélation de différents types de donnéesPouvez-vous montrer même quelques observations (lignes) de données? Difficile d'imaginer votre problème.
Re: Corrélation de différents types de donnéesQuelques lignes de données attachées.
Re: Corrélation de différents types de donnéesVotre réponse ne contient aucun exemple sous aucune forme.
Veuillez également expliquer la nature des variables. valeurs delta CT et biomasse en grammes ou en nombre de graines, ainsi que le but de votre analyse de la corrélation.
Re: Corrélation de différents types de donnéesJ'ai joint une feuille de calcul Excel qui contenait mes données en colonnes. La valeur CT est un un ou une unité reçue à partir des résultats de qPCR utilisés pour mesurer l’expression du gène dans un échantillon de tissu végétal. Par exemple, plus la valeur CT est élevée, plus le nombre de copies du gène est élevé et plus l'expression est élevée. On m'a demandé s'il y avait une corrélation entre l'expression génique du tissu végétal et la biomasse de la plante aux traitements donnés. Il en va de même de la biomasse Ox, Myc, 4End et Bs de la pousse, des racines et du poids des graines. et le nombre de graines sont en corrélation avec la valeur Agp CT du gène exprimé par Ox + Myc + 4End + Bs et ainsi de suite. Quelqu'un a suggéré que les valeurs de R au carré sont ce que je regarderais, mais cela n'a aucun sens pour moi.
Re: Corrélation de différents types de donnéesJe ne vois toujours aucune pièce jointe à une réponse dans ce fil de discussion.
Re: Corrélation de différents types de donnéesOk, essayons encore:
J'ai joint une feuille de calcul Excel qui contenait mes données en colonnes. La valeur CT est un un ou une unité reçue à partir des résultats de qPCR utilisés pour mesurer l’expression du gène dans un échantillon de tissu végétal. Par exemple, plus la valeur CT est élevée, plus le nombre de copies du gène est élevé et plus l'expression est élevée. On m'a demandé s'il y avait une corrélation entre l'expression génique du tissu végétal et la biomasse de la plante aux traitements donnés. Il en va de même de la biomasse Ox, Myc, 4End et Bs de la pousse, des racines et du poids des graines. et le nombre de graines sont en corrélation avec la valeur Agp CT du gène exprimé par Ox + Myc + 4End + Bs et ainsi de suite. Quelqu'un a suggéré que les valeurs de R au carré sont ce que je regarderais, mais cela n'a aucun sens pour moi.
Re: Corrélation de différents types de donnéesLes données sont dans un classeur Excel. Utilisez-vous JMP?
J'ai utilisé la régression multiple pour évaluer la relation entre le poids sec des pousses, le poids sec des racines, le poids des graines, Myc, 4End et Bs avec les réponses séparément, CT Agp et CT Racp. J'ai inclus des termes quadratiques pour les facteurs quantitatifs car mon analyse initiale indiquait une non-linéarité. Je n'ai inclus aucun terme pour les effets d'interaction potentiels.
L'Agp Shoot CT présente les effets les plus importants. Le facteur Myc n'est probablement pas significatif. Le profileur est le moyen le plus simple d'interpréter le modèle.
Il n'y a qu'une relation faible pour le CT racine Agp. Il semble y avoir deux fois plus de variation dans cette réponse par rapport à la première réponse, mais beaucoup moins est corrélée aux changements des facteurs. Est-il logique que la réponse présente un minimum près du poids sec de la pousse moyenne?
Mes observations sont:
- Cet ensemble de données est petit et la puissance de détection des effets actifs est faible.
- L'expérience variait 6 facteurs sur 10 analyses, ce qui confondait de nombreux effets.
- Les niveaux de facteurs Myc, 4End et Bs ont été enregistrés de manière incorrecte ou cette expérience n’a pas été conçue à l’aide de principes statistiques. Il existe des corrélations inutiles entre les facteurs qui réduisent l'efficacité des données d'estimation.
Re: Corrélation de différents types de donnéesOui, j'utilise JMP.
