Hay momentos en los que un gráfico producido en Graph Builder y uno producido en otra plataforma, Fit Y by X por ejemplo, se verá diferente porque los temas de color difieren de forma predeterminada. El tema de color predeterminado de JMP es rojo, verde, azul, naranja, etc. Sin embargo, en Graph Builder se hace una excepción intencional para la familia de temas de color JMP Default. Queremos evitar un gráfico con solo rojo y verde como los dos primeros colores, para nuestros usuarios daltónicos. Por esta razón, Graph Builder gira ligeramente los temas de color.
El valor predeterminado de Graph Builder es una variación del valor predeterminado de JMP con la siguiente lógica: El valor predeterminado de Graph Builder es el mismo que el tema predeterminado de JMP con una reorganización de cada triplete. Para cada triplete en el tema predeterminado de JMP, Graph Builder toma el orden: #3, #1, #2. Por lo tanto, los colores 1, 2 y 3 en Graph Builder son los colores 3, 1 y 2 de JMP Default. El siguiente triplete significa que el 4.°, 5.° y 6.° color para Graph Builder es el 6.°, 4.° y 5.° color del valor predeterminado de JMP, y así sucesivamente. Por lo tanto, el tema de color de Graph Builder es azul, rojo, verde, morado, etc.

Desafortunadamente, no existe una preferencia para configurar el tema de color de Graph Builder para que se aplique a todos los gráficos dentro de JMP.Puede usar un complemento (descárguelo de esta publicación) para agregar el tema de color JMP Default Graph Builder a la lista de temas de color disponibles en Preferencias. Una vez que el complemento esté instalado, haga clic en Complementos y seleccione Tema de color de Graph Builder.

Luego navegue a Preferencias -> Gráficos y elija (por ejemplo) el Tema de color categórico. Se ha agregado el tema de color JMP Default Graph Builder, y ahora puede establecerlo como el tema de color preferido.

Muchas gracias por la explicación 
El esquema de color descrito ahora está disponible directamente como Jmp Azul Rojo Verde.

Aquí hay una descripción general de la secuencia de colores en GraphBuilder (GB) y otras gráficas para los diferentes temas de color:

¿Es posible deshabilitar el tema de color del generador de gráficos? En un script personalizado, deseo colorear manualmente los ajustes de spline, pero el valor predeterminado actual hace que tenga que cambiar mi propio tema de color en función de si tengo dos o más de dos colores.