¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Hola, me estoy preparando para comenzar mi programa de maestría y quiero estar lo más preparado posible en el diseño, implementación y análisis de mi (s) experimento (s). Investigaré la degradación biológica de una sustancia cancerígena conocida como aflatoxina B1. Debido a la naturaleza de mi experimento, tengo un factor difícil de cambiar y trabajaré con un diseño de parcela dividida. He generado numerosos diseños utilizando diferentes números de corridas, gráficos completos y niveles de cada factor; El objetivo es maximizar el poder y minimizar la varianza. He visto en la literatura, y se me brindó orientación, que cada uno de mis factores debería tener un poder> 0,8 en un experimento biológico y haber evaluado la calidad de mis diseños en parte con esa información. De todos modos, he generado un diseño factible en el que toda mi potencia de factor de trazado es 0.923 y todos los demás factores hasta interacciones de 2º nivel son 1.
Mi preocupación reside en el VIF = 12.37 del factor de la trama completa (todos los demás VIF para los factores de subplot y las interacciones de segundo nivel están entre 1 y 1.72). En otros diseños que he creado el VIF para todo el factor de trazado ha sido entre 15 y 45. De la literatura que he encontrado (que está limitada por todas las cuentas), el VIF más alto aceptable es 10, lo que indica una multicolinealidad de 0.1. ¿Se cumple esta expectativa en los diseños de parcelas divididas, o se entiende que el VIF será más alto? ¿Se compensa esto usando el GLS vs. Se aproxima OLS, y ¿se detecta automáticamente en JMP al ajustar Y por X? Cualquier ayuda es apreciada!
Factor | Tipo | Nivel bajo | Nivel central | Nivel alto |
Temperatura de incubación | Difícil de cambiar | 20 ° C | 24 ° C | 28 ° C |
Concentración de Aflatoxina | Fácil de cambiar | 0 ppb | 5000 ppb | 10000 ppb |
Madera en Sustrato | Fácil de cambiar | 0% | 15% | 30% |
Inoculado w / P. ostreatus | Fácil de cambiar | No | N / A | Sí |
Diseño experimental:
- Diseño de parcelas divididas: N = 144
- 16 parcelas completas: cada parcela es una cámara de incubación ajustada a una temperatura específica.
- 9 subparcelas en cada parcela completa: cada parcela es una bolsa de polipropileno que contiene 100 g de sustrato.
Re: ¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?El 6: 3: 7 es más eficiente que el 6: 4: 6, ya que está más cerca del 2: 1: 2 de un diseño de punto central. De todos modos, esto explicaría por qué el VIF para toda la parcela es del orden de 10 a 50, en lugar del infinito (que sería mi expectativa si no hubiera niveles de tratamiento de la parcela completa). Los medios secundarios pueden ayudar mucho a explicar la variabilidad de los medios completos de gráficos en sus datos.
Steve Denham
Re: ¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?Están a diferentes temperaturas. La forma en que se diseñó el experimento, tengo 6 incubadoras a 20C, 3 a 24C y 7 a 28C. Parece que tendría más sentido tener 6 en 20C, 4 en 24C y 6 en 28C, pero no es así como JMP lo generó. De todos modos, las enzimas operan más o menos eficientemente a diferentes temperaturas y queremos saber si esto alterará la capacidad de degradar la sustancia en cuestión. Si todos fueran iguales, habría optado por el diseño factorial completo y habría podido reducir drásticamente el número de corridas necesarias.
Re: ¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?No hay problema, y quiero ser más claro de lo que era. Primero, solo observé la fórmula para calcular el VIF y noté que existía una dependencia automática si el valor nulo era verdadero (todos los medios de subparcela siempre predecirían perfectamente todos los medios de la parcela). Por lo tanto, hice el salto de fe (no siempre es una buena idea, especialmente con los comités de graduados) de que se esperaría un gran VIF debido al diseño.
Ahora pasemos a otra pregunta (de nuevo, al igual que los exámenes de calificación). ¿Están todas las parcelas, las 16 cámaras, todas a la misma temperatura, u 8 a 2 o 4 a 4? La razón por la que pregunto es que si están todos configurados para el mismo temperatura, probablemente deberías tratar toda la trama como un efecto aleatorio, y luego VIF no tiene sentido.
Steve Denham
Re: ¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?Gracias Steve ¿Conoce alguna literatura que apoye esta idea, o se supone que es de conocimiento general que no estoy entendiendo debido a mi falta de experiencia? Probablemente pueda comprender que quiero tener una defensa definitiva en caso de que mi comité de graduados lo cuestione. ¿Está diciendo que siempre hay una colinealidad perfecta entre los medios de la trama completa, o en mi caso particular? Estoy trabajando duro para lograr una mejor comprensión de estos conceptos y me siento frustrado conmigo mismo por no tener dominio de ellos. Estoy leyendo libros y artículos (Goos, Jones, Montgomery, etc.) y viendo incesantemente lecturas estadísticas y bioestadísticas. Solo he tenido la oportunidad de obtener una clase de bioestatos básicos en mi haber, donde el concepto más avanzado era ANOVA de una sola vía y ni siquiera separamos los medios. Excusas, excusas, pero me disculpo por no haber recibido completamente esto todavía.
Re: ¿VIF aceptable para el factor de parcela completa en un diseño de parcela dividida?En una parcela dividida, bajo un nulo sin diferencias en los medios, tendría una perfecta colinealidad entre los medios de la trama completa. Personalmente, no creo que el examen del VIF para parcelas completas en un diseño de parcelas divididas sea significativo.
Steve Denham
