VIF acceptable pour le facteur de tracé entier dans une conception en tracé fractionné?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Bonjour, je me prépare à commencer mon programme de maîtrise et souhaite être le plus préparé possible à la conception, à la mise en œuvre et à l'analyse de mes expériences. Je vais étudier la dégradation biologique d'une substance cancérogène connue sous le nom d'aflatoxine B1. En raison de la nature de mon expérience, j'ai un facteur difficile à changer et je vais travailler avec une conception en parcelles divisées. J'ai généré de nombreux modèles en utilisant différents nombres de cycles, de parcelles entières et de niveaux de chaque facteur. l'objectif étant de maximiser le pouvoir et de minimiser la variance. J'ai vu dans la littérature, et j'ai reçu des directives, que chacun de mes facteurs devrait avoir un pouvoir> 0,8 dans une expérience biologique et que j'avais évalué la qualité de mes conceptions en partie sur la base de cette information. Quoi qu’il en soit, j’ai généré une conception réalisable dans laquelle la puissance totale de mon facteur de parcelle est de 0,923 et tous les autres facteurs jusqu’à 1.
Ce qui me préoccupe, c’est le VIF = 12,37 du facteur de la parcelle entière (tous les autres VIF pour les facteurs de sous-parcelle et les interactions de deuxième niveau sont compris entre 1 et 1,72). Dans d'autres conceptions, le VIF que j'ai créé pour l'ensemble du facteur de parcelle était compris entre 15 et 45. Dans la littérature que j'ai rencontrée (ce qui est limité par tous les comptes), le VIF acceptable le plus élevé est 10, indiquant une multicolinéarité de 0,1. Cette attente est-elle vraie dans les conceptions en parcelles divisées, ou est-ce que l'on comprend que le VIF sera plus élevé? Est-ce compensé par l’utilisation du GLS par rapport à L’approche OLS est-elle automatiquement détectée dans JMP lors de l’ajustement de Y par X? Toute aide est appréciée!
Facteur | Type | Niveau faible | Niveau central | Haut niveau |
Température d'incubation | Difficile à changer | 20 ° C | 24 ° C | 28 ° C |
Concentration en aflatoxine | Facile à changer | 0 ppb | 5000 ppb | 10000 ppb |
Bois dans le substrat | Facile à changer | 0% | 15% | 30% |
Inoculé avec P. ostreatus | Facile à changer | Non | N / A | Oui |
Conception expérimentale:
- Conception en parcelles divisées: N = 144
- 16 parcelles entières - chaque parcelle entière est une chambre d'incubation réglée à une température spécifique.
- 9 sous-parcelles dans chaque parcelle entière - chaque sous-parcelle est un sac en polypropylène contenant 100 g de substrat.
Re: VIF acceptable pour le facteur de la parcelle entière dans une conception en parcelles divisées?Le format 6: 3: 7 est plus efficace que le format 6: 4: 6, car il est plus proche du format 2: 1: 2 d'un point central. Quoi qu'il en soit, cela expliquerait pourquoi la VIF pour l'ensemble de la parcelle est de l'ordre de 10 à 50, plutôt que l'infini (ce à quoi je m'attendrais s'il n'y avait pas de niveaux de traitement de la parcelle entière). Les sous-parcelles signifient beaucoup pour expliquer la variabilité de la parcelle entière dans vos données.
Steve Denham
Re: VIF acceptable pour le facteur de la parcelle entière dans une conception en parcelles divisées?Ils sont à des températures différentes. A la manière dont l'expérience a été conçue, j'ai 6 incubateurs à 20 ° C, 3 à 24 ° C et 7 à 28 ° C. Il semble plus logique d’avoir 6 à 20C, 4 à 24C et 6 à 28C, mais ce n’est pas ainsi que JMP l’a généré. Quoi qu'il en soit, les enzymes agissent plus ou moins efficacement à différentes températures et nous voulons savoir si cela modifiera la capacité de dégradation de la substance en question. S'ils étaient tous identiques, j'aurais opté pour la conception factorielle complète et aurais pu réduire considérablement le nombre de cycles nécessaires.
Re: VIF acceptable pour le facteur de la parcelle entière dans une conception en parcelles divisées?Pas de problème, et je veux être plus clair que j'étais. Premièrement, j’ai juste regardé la formule de calcul de VIF et constaté qu’il existait une dépendance automatique si la valeur null était vraie (toutes les moyennes de sous-parcelle prédiraient toujours parfaitement les moyennes de la parcelle). Ainsi, j'ai fait le saut de la foi (pas toujours une bonne idée, en particulier avec les comités de diplômés) que de grands VIF seraient attendus à cause de la conception.
Passons maintenant à une autre question (encore une fois, tout comme les examens de qualification). Les parcelles entières, les 16 chambres sont-elles toutes à la même température, 8 à 2 ou 4 à 4? La raison pour laquelle je pose cette question est que s’ils sont tous prêts à même température, vous devriez probablement traiter toute l’intrigue comme un effet aléatoire, et VIF n’a alors aucun sens.
Steve Denham
Re: VIF acceptable pour le facteur de la parcelle entière dans une conception en parcelles divisées?Merci Steve. Connaissez-vous des ouvrages qui soutiendraient cette idée, ou est-il présumé que tout le monde sait que je ne comprends pas en raison de mon manque d'expérience? Vous pouvez probablement comprendre que je souhaite avoir une défense définitive au cas où mon comité des diplômés remettrait en question cette question. Êtes-vous en train de dire qu'il y a toujours une colinéarité parfaite entre les moyens de l'intrigue, ou dans mon cas particulier? Je travaille dur pour mieux comprendre ces concepts et je suis frustré par le fait que je ne les maîtrise pas. Je lis des livres et des articles (Goos, Jones, Montgomery, etc.) et je regarde sans cesse des conférences de statistiques et de biostatistiques. Je n'ai eu que l'opportunité de suivre un cours de biostats de base, le concept le plus avancé étant celui de l'ANOVA unidirectionnel et nous n'avons même pas séparé les moyens. Des excuses, des excuses, mais je m'excuse de ne pas l'avoir tout à fait.
Re: VIF acceptable pour le facteur de la parcelle entière dans une conception en parcelles divisées?Dans une parcelle divisée, sous un zéro sans aucune différence de moyennes, vous auriez une colinéarité parfaite entre les moyennes d'une parcelle entière. Personnellement, je ne pense pas que l'examen de la VIF pour des parcelles entières dans une conception en parcelles divisées soit significatif.
Steve Denham
