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17240_ko-KR

liliconcom

Haplotype 회귀 분석

haplotype regression 함수를 실행 중이고 정확하게 출력 파일을 해석하는 방법이 불분명합니다. 내가 가장 관심을 갖는 것은 각 일배 체형에 대한 형질의 평균을 결정하는 것이다. SAS 출력 창에서 각 haplotype에 대한 견적 값이 제공됩니다. 이 값들은 전체 시험에서 모든 일배 체형에 대해 모두 부정적이며 일부는 일부 일배 체형에 대해 음성이고 개별 시험에서 다른 일원에 긍정적입니다. 어떤 도움을 주시면 감사하겠습니다. 아래 출력을 첨부했습니다.

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

전체 테스트 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 20

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

전체 테스트 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 21

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 7 0.57061574 0.08151653 5.13 <.0001

오류 124 1.97091759 0.01589450

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.224516 59.09690 0.126073 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.68 0.1039

H2 1 0.01099720 0.01099720 0.69 0.4071

H3 1 0.15427488 0.15427488 9.71 0.0023

H4 1 0.15181720 0.15181720 9.55 0.0025

H5 1 0.13429041 0.13429041 8.45 0.0043

H6 1 0.07494326 0.07494326 4.72 0.0318

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H1 1 0.00756075 0.00756075 0.48 0.4917

H2 1 0.03763456 0.03763456 2.37 0.1264

H3 1 0.29761793 0.29761793 18.72 <.0001

H4 1 0.24398325 0.24398325 15.35 0.0001

H5 1 0.17124082 0.17124082 10.77 0.0013

H6 1 0.07487811 0.07487811 4.71 0.0319

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

전체 7 0.57061574 0.08151653 5.13 <.0001

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

차단 물 0.2890451760 0.02424577 11.92 <.0001

H1 -.0302601288 0.04387445 -0.69 0.4917

H2 -.0674181711 0.04381340 -1.54 0.1264

H3-1993103565 0.04605998 -4.33 <.0001

H4 -.2019650826 0.05154893 -3.92 0.0001

H5-1.68493234 0.04900484 -3.28 0.0013

H6 -.1115559265 0.05139710 -2.17 0.0319

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

전체 테스트 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 22

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

H7 -.0151106871 0.04705650 -0.32 0.7487

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 1 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 23

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 1 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 24

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

오류 130 2.49887952 0.01922215

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.016783 64.98936 0.138644 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

차단 물 0.2058495133 0.01307144 15.75 <.0001

H1 0.0604036959 0.04054951 1.49 0.1387

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 2 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 25

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 2 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 26

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

오류 130 2.53689236 0.01951456

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.001826 65.48180 0.139695 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

절편 0.2108940059 0.01314754 16.04 <.0001

H2 0.0199012940 0.04080901 0.49 0.6266

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 3 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 27

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 3 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 28

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

오류 130 2.35336747 0.01810283

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.074036 63.06879 0.134547 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

절편 0.2281706052 0.01258261 18.13 <.0001

H3 -.1357147781 0.04209494 -3.22 0.0016

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 4 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 29

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 4 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 30

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

오류 130 2.41709913 0.01859307

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.048960 63.91707 0.136356 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

절편 0.2242132838 0.01259143 17.81 <.0001

H4 -1.2263698272 0.04884826 -2.59 0.0108

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 5 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 31

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 5 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 32

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

오류 130 2.47592448 0.01904557

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.025815 64.69017 0.138006 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

절편 0.2208798843 0.01268136 17.42 <.0001

H5 -.0873881772 0.04708347 -1.86 0.0657

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 6 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 33

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 6 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 34

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

오류 130 2.53656985 0.01951208

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.001953 65.47764 0.139686 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

차단 물 0.2154476441 0.01286049 16.75 <.0001

H6 -.0252461592 0.05005571 -0.50 0.6149

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 7 시험 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 35

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 7 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 36

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

오류 130 2.49282249 0.01917556

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.019166 64.91055 0.138476 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

절편 0.2071830763 0.01265543 16.37 <.0001

H7 0.0721643793 0.04527767 1.59 0.1134

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 8 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 37

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

관찰 횟수 132

사용 된 관측 수 132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

Haplotype 8 검사 16:33 2016 년 2 월 29 일 월요일 38

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM 절차

종속 변수 : PSS_2013

의 합

소스 DF 제곱 평균 제곱근 값 Pr> F

모델 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

오류 130 2.01462312 0.01549710

수정 된 합계 131 2.54153333

R-Square Coeff Var 루트 MSE PSS_2013 평균

0.207320 58.35345 0.124487 0.213333

소스 DF 유형 I SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

소스 DF 유형 III SS 평균 정사각형 F 값 Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

콘트라스트 DF 대비 SS 평균 자승 F 값 Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

표준

매개 변수 추정 오류 t 값 Pr> | t |

차단 물 0.1932524844 0.01136935 17.00 <.0001

H8 0.2484527632 0.04260894 5.83 <.0001

======================================================================================================== ========================================================================================================

다시 : Haplotype 회귀

안녕하세요,

나는 이전의 대답에서 LS가 말했을 때 나는 스스로를 시정해야한다; 대신, LS 방법으로 정의한 값은 실제로 각 일배 체형에 대한 예측 된 수단입니다.

사과드립니다.

루치아노 실바

다시 : Haplotype 회귀

안녕하세요,

귀하의 질문을 정확하게 이해한다면 각 haplotype의 최소 제곱 평균 (LS 평균)이 필요합니다. 종합 시험과 개별 시험의 결과가 있기 때문에 각 haplotype에 대해 2 가지 LS 평균을 얻을 수 있습니다. 두 경우 모두, 일배 체형에 대한 LS 수단은 절편과 일배 체형 추정치의 합이다. 종합 시험에서 LS 방법은 모델에 함께 들어 맞는 다른 일배 체형을 조건으로하며, 모델을 변경하면 (예 : 모형에서 일배 체형을 제거하십시오), 개별 시험의 LS 방법은 다른 일배 체형에 조건이 없습니다. 모델에는 단 하나의 일배 체형 만 있습니다.

LS는 H1 (전체 테스트) = 0.2890451760 + (-.0302601288) = 0.2587850472

LS는 H1 (개별 시험) = 0.2058495133 + 0.0604036959 = 0.2662532092를 의미한다

감사합니다.

루치아노 실바

다시 : Haplotype 회귀

안녕하세요,

이 질문을 게시 해 주셔서 감사합니다.

먼저, 각 haplotype에 대한 특성 (PSS_2013)의 평균을 찾고 있다면, Haplotype Hx에 대한 Test라는 레이블이 붙은 각 섹션을 살펴보십시오. 여기서 x는 Haplotype 번호입니다. 각 섹션에는 PSS_2013 Mean이라는 항목이 있습니다. 그것은 그 일배 체형에 대한 형질에 대한 평균 일 것입니다. 그것은 당신이 찾고있는 것입니까? 각 haplotype에 대한 이러한 개별 섹션은 전체 haplotype이 (처음에) 함께 맞고 전체 적합에 대한 평균이 아닌 개별 haptotype에 대한 개별 테스트입니다 (PSS_2013 Mean은 개별 맞춤 대신 전체 맞춤에 대한 평균 임).

매개 변수 추정치는 개개인의 시험 또는 전체 모형 적합으로서 각 일배 체형에 대한 적합도의 기울기이며, 각 일배 체형에 대한 그 특성에 대한 영향 (+는 긍정적 효과이고 - 부정적인 효과 임)을 나타냅니다. 다른 일배 체형을 고려할 때.

그것은 출력을 설명하는 데 도움이됩니까?

베스트,

크리스 키르히 베르크

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