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17240_ja-JP

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ハプロタイプ回帰

ハプロタイプ回帰関数を実行していますが、出力ファイルの解釈方法が正確には不明です。私が最も興味を持っているのは、各ハプロタイプの形質の平均を決めることです。SAS出力ウィンドウには、各ハプロタイプの推定値が表示されています。これらの値は、全体的な試験における全てのハプロタイプについて全て陰性であり、一方、いくつかのハプロタイプについては陰性でありそして個々の試験において他のものについては陽性である。任意の助けがいただければ幸いです。私は出力を下に添付しました：

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総合テスト16:33 2016年2月29日月曜日20

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GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

総合テスト16:33 2016年2月29日月曜日21

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル7 0.57061574 0.08151653 5.13 <.0001

エラー124 1.97091759 0.01589450

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.224516 59.09690 0.126073 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.68 0.1039

H2 1 0.01099720 0.01099720 0.69 0.4071

H3 1 0.15427488 0.15427488 9.71 0.0023

H4 1 0.15181720 0.15181720 9.55 0.0025

H5 1 0.13429041 0.13429041 8.45 0.0043

H6 1 0.07494326 0.07494326 4.72 0.0318

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H1 1 0.00756075 0.00756075 0.48 0.4917

H2 1 0.03763456 0.03763456 2.37 0.1264

Ｈ３１０．２９７６１７９３０．２９７６１７９３１８．７２＜．０００１

H4 1 0.24398325 0.24398325 15.35 0.0001

H5 1 0.17124082 0.17124082 10.77 0.0013

H6 1 0.07487811 0.07487811 4.71 0.0319

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

全体7 0.57061574 0.08151653 5.13 <0.0001

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2890451760 0.02424577 11.92 <.0001

H1 -.0302601288 0.04387445 -0.69 0.4917

H2 -0674181711 0.04381340 -1.54 0.1264

H 3 -.1993103565 0.04605998 -4.33 <.0001

H 4 -2019650826 0.05154893 -3.92 0.0001

H5 -.1608493234 0.04900484 -3.28 0.0013

H6 -11115559265 0.05139710 -2.17 0.0319

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

総合テスト16:33 2016年2月29日月曜日22

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

H7 -.0151106871 0.04705650 -0.32 0.7487

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ1のテスト16:33 2016年2月29日月曜日23

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ1のテスト16:33 2016年2月29日月曜日24

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

エラー130 2.49887952 0.01922215

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.016783 64.98936 0.138644 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H 1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H 1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H 1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2058495133 0.01307144 15.75 <.0001

H1 0.0604036959 0.04054951 1.49 0.1387

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ2のテスト16:33 2016年2月29日月曜日25

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ2のテスト16:33 2016年2月29日月曜日26

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

エラー130 2.53689236 0.01951456

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.001826 65.48180 0.139695 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2108940059 0.01314754 16.04 <.0001

H2 0.0199012940 0.04080901 0.49 0.6266

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ3のテスト16:33 2016年2月29日月曜日27

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ3のテスト16:33 2016年2月29日月曜日28

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

エラー130 2.35336747 0.01810283

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.074036 63.06879 0.134547 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2281706052 0.01258261 18.13 <.0001

H3 -.1357147781 0.04209494 -3.22 0.0016

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ4のテスト16:33 2016年2月29日月曜日29

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ4のテスト16:33 2016年2月29日月曜日、30

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

エラー130 2.41709913 0.01859307

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.048960 63.91707 0.136356 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2242132838 0.01259143 17.81 <.0001

H4 -.1263698272 0.04884826 -2.59 0.0108

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ5のテスト16:33 2016年2月29日月曜日、31

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ5のテスト16:33 2016年2月29日月曜日32

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

エラー130 2.47592448 0.01904557

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.025815 64.69017 0.138006 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H 5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H 5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H 5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2208798843 0.01268136 17.42 <0.0001

H5 -.0873881772 0.04708347 -1.86 0.0657

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ6のテスト16:33 2016年2月29日月曜日、33

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ6のテスト16:33 2016年2月29日月曜日34

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

エラー130 2.53656985 0.01951208

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.001953 65.47764 0.139686 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2154476441 0.01286049 16.75 <0.0001

H6 -.0252461592 0.05005571 -0.50 0.6149

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ7のテスト16:33 2016年2月29日月曜日、35

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ7のテスト16:33 2016年2月29日月曜日36

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

エラー130 2.49282249 0.01917556

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.019166 64.91055 0.138476 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.2071830763 0.01265543 16.37 <.0001

H7 0.0721643793 0.04527767 1.59 0.1134

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ8のテスト16:33 2016年2月29日月曜日、37

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

観測された観測数132

使用観測数132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

ハプロタイプ8のテスト16:33 2016年2月29日月曜日38

-------------------------------------------------- -----------ウィンドウ= 1 ------------------------------------ -------------------------

GLMの手続き

従属変数：PSS_2013

の合計

ソースDF二乗平均平方F値Pr> F

モデル1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

エラー130 2.01462312 0.01549710

修正された合計131 2.54153333

R二乗係数バールートMSE PSS_2013平均

0.207320 58.35345 0.124487 0.213333

ソースDFタイプI SS平均二乗F値Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

ソースDFタイプIII SS平均二乗F値Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

コントラストDFコントラストSS平均二乗F値Pr> F

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

標準

パラメータ推定誤差t値Pr> | t |

切片0.1932524844 0.01136935 17.00 <.0001

H 8 0.2484527632 0.04260894 5.83 <.0001

=================================================== ===================================================

ハプロタイプ回帰

こんにちは、

前回の返信でLS Meansと言ったときは、自分自身を訂正する必要があります。代わりに、LS Meansとして定義した値は、実際に各ハプロタイプの予測平均です。

謝罪いたします。

ルチアーノシルバ

ハプロタイプ回帰

こんにちは、

私があなたの質問を正しく理解したならば、あなたはそれぞれのハプロタイプの最小二乗平均（LS平均）を望みます。総合検定と個別検定の結果があるので、各ハプロタイプについて2つのLS平均推定値を得ることができます。いずれの場合も、ハプロタイプのLS平均は切片とハプロタイプの推定値の合計です。全体検定のLS平均はモデルに適合する他のハプロタイプを条件としており、モデルを変更すると（モデルからハプロタイプを削除するなど）変更される可能性がありますが、個別検定のLS平均は他のハプロタイプと無条件です。モデルにはハプロタイプが1つしかありません。

LS平均値H1（総合検定）= 0.2890451760 +（-.0302601288）= 0.2587850472

LS平均値H1（個別検定）= 0.2058495133 + 0.0604036959 = 0.2662532092

敬具、

ルチアーノシルバ

ハプロタイプ回帰

こんにちは、

この質問を投稿していただきありがとうございます。

まず、あなたがそれぞれのハプロタイプについてあなたの形質の平均値（PSS_2013）を探しているならば、それからハプロタイプHxのためのテストとラベル付けされたそれぞれのセクションを見てください。ここでxはハプロタイプ番号です。各セクション内にPSS_2013 Meanという項目があります。それがそのハプロタイプの形質にとって意味があるでしょう。それはあなたが探しているものですか？各ハプロタイプについてのこれらの個々のセクションは、すべてのハプロタイプが（初めに）一緒に適合するモデル全体の適合とは対照的に、各ハプロタイプについての個々の検定であり、PSS_2013平均は個々の適合の代わりに全体の適合の平均です。

パラメータ推定値は、個々の検定またはモデル全体の近似としての各ハプロタイプの近似の傾きであり、各ハプロタイプのその特性に対する効果（+は正の効果、- は負の効果）を表します。他のハプロタイプを検討するとき。

それは出力を説明するのを助けますか？

ベスト、

クリス・キルヒベルク

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