nav[aria-label="Primary Navigation"] { padding: 0; & ul { list-style: none; width: 100%; display: flex; flex-direction: row; justify-content: start; align-items: start; gap: 30px; padding: 0; & li { margin: 0; } & ul li { list-style: none; } } }

17240_zh-TW

liliconcom

單倍型回歸

我正在運行單倍型回歸函數，目前還不清楚如何解釋輸出文件。我最感興趣的是確定每個單倍型的特徵平均值。在SAS輸出窗口中，我給出了每個單倍型的估計值。這些值對於整個測試中的所有單倍型都是陰性的，而一些對於某些單倍型是陰性的並且在個體測試中對於其他單倍型是陽性的。任何幫助，將不勝感激。我附上以下輸出：

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

總體測試16:33 2016年2月29日，星期一20

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

總體測試16:33 2016年2月29日，星期一21

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號7 0.57061574 0.08151653 5.13 <.0001

錯誤124 1.97091759 0.01589450

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.224516 59.09690 0.126073 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.68 0.1039

H2 1 0.01099720 0.01099720 0.69 0.4071

H3 1 0.15427488 0.15427488 9.71 0.0023

H4 1 0.15181720 0.15181720 9.55 0.0025

H5 1 0.13429041 0.13429041 8.45 0.0043

H6 1 0.07494326 0.07494326 4.72 0.0318

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H1 1 0.00756075 0.00756075 0.48 0.4917

H2 1 0.03763456 0.03763456 2.37 0.1264

H3 1 0.29761793 0.29761793 18.72 <.0001

H4 1 0.24398325 0.24398325 15.35 0.0001

H5 1 0.17124082 0.17124082 10.77 0.0013

H6 1 0.07487811 0.07487811 4.71 0.0319

H7 1 0.00163899 0.00163899 0.10 0.7487

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

總計7 0.57061574 0.08151653 5.13 <.0001

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2890451760 0.02424577 11.92 <.0001

H1 -.0302601288 0.04387445 -0.69 0.4917

H2 -.0674181711 0.04381340 -1.54 0.1264

H3-1.1993103565 0.04605998 -4.33 <.0001

H4 -.2019650826 0.05154893 -3.92 0.0001

H5-1608493234 0.04900484 -3.28 0.0013

H6-1115559265 0.05139710 -2.17 0.0319

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

總體測試16:33 2016年2月29日，星期一22

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

H7 -.0151106871 0.04705650 -0.32 0.7487

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試1 16:33 2016年2月29日星期一23

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試1 16:33 2016年2月29日星期一24

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

錯誤130 2.49887952 0.01922215

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.016783 64.98936 0.138644 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H1 1 0.04265381 0.04265381 2.22 0.1387

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2058495133 0.01307144 15.75 <.0001

H1 0.0604036959 0.04054951 1.49 0.1387

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試2 16:33 2016年2月29日星期一25

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試2 16:33 2016年2月29日星期一26

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

錯誤130 2.53689236 0.01951456

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.001826 65.48180 0.139695 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H2 1 0.00464098 0.00464098 0.24 0.6266

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2108940059 0.01314754 16.04 <.0001

H2 0.0199012940 0.04080901 0.49 0.6266

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試3 16:33 2016年2月29日星期一27

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試3 16:33 2016年2月29日星期一28

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

錯誤130 2.35336747 0.01810283

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.074036 63.06879 0.134547 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H3 1 0.18816586 0.18816586 10.39 0.0016

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2281706052 0.01258261 18.13 <.0001

H3 -.1357147781 0.04209494 -3.22 0.0016

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試4 16:33 2016年2月29日星期一29

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試4 16:33 2016年2月29日星期一30

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

模型1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

錯誤130 2.41709913 0.01859307

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.048960 63.91707 0.136356 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H4 1 0.12443421 0.12443421 6.69 0.0108

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2242132838 0.01259143 17.81 <.0001

H4 -12263698272 0.04884826 -2.59 0.0108

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試5 16:33 2016年2月29日星期一31

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試5 16:33 2016年2月29日星期一32

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

錯誤130 2.47592448 0.01904557

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.025815 64.69017 0.138006 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H5 1 0.06560886 0.06560886 3.44 0.0657

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2208798843 0.01268136 17.42 <.0001

H5 -.0873881772 0.04708347 -1.86 0.0657

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試6 16:33 2016年2月29日星期一33

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試6 16:33 2016年2月29日星期一34

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

模型1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

錯誤130 2.53656985 0.01951208

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.001953 65.47764 0.139686 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H6 1 0.00496349 0.00496349 0.25 0.6149

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2154476441 0.01286049 16.75 <.0001

H6 -.0252461592 0.05005571 -0.50 0.6149

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試7 16:33 2016年2月29日星期一35

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試7 16:33 2016年2月29日星期一36

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

錯誤130 2.49282249 0.01917556

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.019166 64.91055 0.138476 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H7 1 0.04871084 0.04871084 2.54 0.1134

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.2071830763 0.01265543 16.37 <.0001

H7 0.0721643793 0.04527767 1.59 0.1134

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試8 16:33 2016年2月29日星期一37

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

觀察次數閱讀132

使用的觀測數量132

-------------------------------------------------- --------------------------------------------------

單倍型測試8 16:33 2016年2月29日星期一38

-------------------------------------------------- ----------- Window = 1 ------------------------------------ -------------------------

GLM程序

因變量：PSS_2013

總和

源DF平方均方F值Pr> F.

型號0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

錯誤130 2.01462312 0.01549710

更正總計131 2.54153333

R-Square Coeff Var Root MSE PSS_2013均值

0.207320 58.35345 0.124487 0.213333

源DF類型I SS均方F值Pr> F.

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

源DF類型III SS均方F值Pr> F.

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

對比度DF對比度SS均方值F值Pr> F.

H8 1 0.52691021 0.52691021 34.00 <.0001

標準

參數估計誤差t值Pr> | t |

截距0.1932524844 0.01136935 17.00 <.0001

H8 0.2484527632 0.04260894 5.83 <.0001

================================================== ==================================================

回复：單倍型回歸

嗨，

當我在前一個回復中說LS Means時，我必須糾正自己;相反，我定義為LS Means的值確實是每個單倍型的預測平均值。

我很抱歉。

盧西亞諾席爾瓦

回复：單倍型回歸

嗨，

如果我正確理解你的問題，你需要每個單倍型的最小二乘法（LS均值）。由於您有總體測試和個體測試的結果，您可以獲得每個單倍型的兩個LS均值估計值。在任何一種情況下，單倍型的LS均值是截距和單倍型估計的總和。來自整體測試的LS均值是以模型中擬合的其他單倍型為條件的，如果你改變模型（例如，從模型中刪除單倍型）它可能會改變，而來自個體測試的LS均值對其他單倍型是無條件的，因為該模型只有一個單倍型。

LS表示H1（整體測試）= 0.2890451760 +（ - 0.0302601288）= 0.2587850472

LS表示H1（單獨測試）= 0.2058495133 + 0.0604036959 = 0.2662532092

您忠誠的，

盧西亞諾席爾瓦

回复：單倍型回歸

嗨，

感謝您發布此問題。

首先，如果您正在尋找每種單倍型的性狀平均值（PSS_2013），那麼請查看標記為單倍型Hx的每個部分，其中x是單倍型數。在每個部分中都有一個名為PSS_2013 Mean的項目。這將是該單倍型特徵的平均值。那是你在找什麼？每個單倍型的這些單獨部分是每個單倍型的單獨測試，而不是整個模型擬合，其中所有單倍型擬合在一起（在開始時）和PSS_2013平均值是整個擬合的平均值，而不是個體擬合。

參數估計值是每個單倍型的擬合斜率，因為單個測試或整個模型擬合併表示每種單倍型的特徵的效果（+是正效應和 - 是負效應），或者當它們組合在一起時，它們的效果在考慮其他單倍型時。

這有助於解釋輸出嗎？

最好，

克里斯基希伯格

Comments

There are no comments yet