背景：我有6個人，每個人分配到治療組或對照組（每組3個）。我想比較治療效果，並將“個體”作為混合模型中的隨機效應和“治療”（T或C）作為固定效應。
問題：我發現根據我如何標記我的複製品（個體）得到不同的結果。在實驗中，我將個體組織為1,2,3，在治療組中，4,5,6，在對照組中。這就是我最初在我的混合模型中包含“個體”的方式，但我一直被告知這是不正確的並且使治療效果混淆，因為個體在治療期間沒有重複，並且每個人僅被分配一次治療。相反，我需要在處理的重複結構中具有標稱值（C中的1,2,3和T中的1,2,3）。取決於我如何構建“個體”隨機複製效果：（T-1,2,3和C-1,2,3）與（T-1,2,3和C-4，5,6，）
問題：我不完全理解為什麼治療中的重複結構是正確的，我正在尋求進一步的澄清。
聽起來你有一些不好的建議。 除非您將受試者置於治療範圍內，否則JMP會將數據視為您在對照組和治療組中均有3名受試者進行治療。 實際上，您有6個科目只分配到1組。 這就是為什麼你會遇到不匹配的問題，而且據我所知，你第一次就做對了。
如果使用第二種標記方法，則在處理中嵌入主題ID時應獲得相同的結果。 我附上一個例子來說明我為假研究生成了一些數據，在0和1週時測量了每個治療水平的4名受試者。 我創建了2個主題ID列，以說明我可以這樣做，如果我正確嵌套它可以得到相同的結果。 第一個腳本為每個主題使用唯一ID。 第二個使用為每個治療組重複的名義ID，但我將治療組中的主題嵌套。 我得到完全相同的數字。 這是因為嵌套告訴JMP T組中的Subject 1與C組中的Subject 1不同。
第三個腳本顯示沒有嵌套的錯誤方法。 現在結果是不同的，因為JMP將兩組中的受試者1視為同一個人，並認為我對此人進行了4次測量。 這基本上就是我認為您對數據所做的。
我還想詢問每個人是否有超過1個數據點？例如，在我上傳的數據集中，我在2個時間段測量它們。 如果您只有1個數據點，則主題與殘差混淆（未按照您的建議進行處理）。 如果是這樣的話，那不是一個真正的問題。 JMP只是從REML方差組件表中刪除“Residual”並將其替換為“Subject”。您的治療效果仍然完全可以估計。
