赤外分光法およびクロマトグラフィーに関する機能データのアプリケーション赤外分光法とクロマトグラフィーでの Functional Data Explorer の使用について問い合わせがあります。波形の例を以下に貼り付けます。顧客にデータ テーブルを送ってもらうようにしています。アプリケーションは、これらを DOE からの応答として使用します。赤外線分光法では、特定の波数でのピークの存在は興味深いものです。クロマトグラフィーの場合、ある時点 (x 軸は時間) での曲線の下の領域が興味深いものです。X 軸の位置合わせと基底応答の減算についても議論がありました。
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/spectrpy/infrared/infrared.htm
https://www.researchgate.net/figure/High-performance-liquid-chromatography-HPLC-chromatograms-of-the-flavonoids-in-CN30_fig1_281614653
Re: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請マーティンさん、
あなたの提案 P-Splines は、私が FDE を使用して遊んでいるものです。私はまだFTを試していませんが、スプラインフィットよりもうまくいくかどうかも懐疑的です....少なくともスペクトルデータについては。データをスタックする代わりに、Rows as Function を使用することで、うまく機能しているように思えます。NIR および Mass Spec データの Rows as Functions と P-Splines で良い結果が得られました。NMR データで問題が発生しましたが、そのデータを再検討して新しいことを試す必要があります。
ただし、最終的には、予測モデルに適合させるために PLS または Gen Reg を使用し、Gen Reg のスキャニング Elastic Net を使用して、連続応答データと二項応答データの両方について PLS モデルと同等またはそれ以上の非常に優れた予測モデルを見つけています。
Re: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請JMP Development は最近、このようなデータを使用してお客様と良い議論を交わしたと思います。 そのため、現在のようにスペクトル データとクロマトグラフィー データ (および XRD などの同様のデータ) が FDE にとって難しい理由をよく理解しています。 願わくば、彼らがこれを新しいアプリケーションや JMP Pro の新しいユーザーに開放できるソリューションを見つけることができるようになることを願っています!
Re: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請かなり前ですが、
Phil/Mike/Bill のコメントを追加すると、この種のデータは FDE 標準ノットに適合するのが難しくなります。フーリエ (ただし、これは片側でオーバースイングする可能性があります) を試すか、ピーク変動の近くでノットを調整する P-スプラインを試してください。 これは、スムージングの影響を排除するのに役立ちます。 多くの場合、これは重要ではありませんが、ピークのさまざまな位置 (hight、auc、...) に関心がある場合、これは重要になる可能性があります。
地震計および信号処理の顧客との過去の仕事から、ノイズのフィルタリングは重要でしたが、FDE にはまだ優れたフィルタリング技術がありません。 これは、データ処理に大いに役立つと思います。
しかし、私はそれを試してみて、あなたが（現在）どれだけうまくいくか見てみたいと思います. 私は非線形でカーブフィットのプラットフォームが好きですが、彼らがまともな仕事をするとは確信していません
Re: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請お客様との私の経験から、IR スペクトルとクロマトグラフィーは FDE の有用なアプリケーションです。 GSK は、FDE を使用してクロマトグラフィー メソッドを最適化する方法について数回発表しました (プレゼンテーションを共有することはできませんでしたが)。 別の顧客が FTIR スペクトルを見ています。
どちらの場合も、スペクトル/クロマトグラム全体を見ていませんでした。 それらは、関心のある特定の領域/ピークに焦点を当てています。
上記の例は私には少し「忙しい」ように見え、FDE が苦労する可能性があると思います。 しかし、それは実際には状況によって異なります。機能間の変動の性質と、データから何を見つけたいかによって異なります。
ベースラインを差し引くことは、これらの状況での一般的なデータ準備です。 今のところ FDE でこれを行う簡単な方法はありませんが、うまくいけば追加されるでしょう。
曲線下面積に役立つ可能性がある FDE 要約統計の 1 つとして、Root Integrated Function Square を見てください。Re: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請おい！
とは違う視点かも@Bill_Worley . PLS ブックの NIR データは、FDE で非常にうまく機能する IR スペクトルの好例です。 スペクトルのピークがより鋭くなると、本当に良いトレースを行う能力が低下します。 この関数は、トップ/ボトムのスパイク ビットを丸めようとします。 XRDスペクトル、質量分析、NMRでこの問題が発生しました。 とはいえ、トレースから多くの優れた情報を得ることができます (スペクトル内のアクティブ領域の識別など... Pete の Discovery Talk を参照してください...)。 また、このトピックに慣れていない人にとっては、その PLS に頭を悩ませる方がずっと簡単だと思います。 私は FDE で牽引力を得ることができましたが、PLS は彼らの頭の上を行きます。
クロマトグラフィー、特に AUC 計算では、非線形またはフィット カーブ (IMO) を使用する必要があります。 ただし、ビルが言及しているノイズに対処するために FDE を使用できる場合があります...データのクリーンアップ手順のようなものです。
一番、
MRe: 赤外分光法とクロマトグラフィーに関する機能データの申請ハイド、
あなたが示すIRスペクトルは、純粋な化合物に対するものです。純粋な化合物を調べている場合、検量線を作成できる可能性があります。PLS は、過去にスペクトル データで非常に効果的に使用されてきました。PLS ブックをお持ちの場合は、ガス中のオクタン価の決定に関する優れた説明があります。とはいえ、Pete Hersh は Discovery で FDE で NIR データを操作する例を示しており、その例について彼に連絡することができます。
クロマトグラフィーの場合、時点は特定の化合物の溶出時間です。異なるロットの曲線を比較したい場合を除き、ここで FDE が正しい答えであるかどうかはわかりませんが、以前は間違っていました。通常、クロマトグラフィーには多くのベースラインノイズがあり、あなたが言及しています。顧客からデータを入手した場合は、喜んでこの問題を解決してください。
一番、
明細書
