Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieIch habe eine Anfrage zur Verwendung des Functional Data Explorer für Infrarotspektroskopie und Chromatographie.Beispielwellenformen sind unten eingefügt und ich versuche, den Kunden dazu zu bringen, mir eine Datentabelle zu schicken.Die Anwendung soll diese als Antworten von DOE verwenden.Für die Infrarotspektrographie ist das Vorhandensein von Peaks bei bestimmten Wellenzahlen interessant.Für die Chromatographie ist die Fläche unter der Kurve zu Zeitpunkten (die x-Achse ist die Zeit) interessant.Es gab auch Diskussionen über das Ausrichten der x-Achse und das Subtrahieren einer Basisantwort.
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/spectrpy/infrared/infrared.htm
https://www.researchgate.net/figure/High-performance-liquid-chromatography-HPLC-chromatograms-of-the-flavonoids-in-CN30_fig1_281614653
Betreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieHey Martin,
Ihr Vorschlag P-Splines ist etwas, mit dem ich mit FDE gespielt habe.Ich habe FT noch nicht ausprobiert, bin aber auch skeptisch, ob es besser als eine Spline-Anpassung sein wird ... zumindest für Spektraldaten.Eine Sache, die meiner Meinung nach gut zu funktionieren scheint, ist die Verwendung der Zeilen als Funktionen, anstatt die Daten zu stapeln.Ich hatte gute Ergebnisse mit NIR- und Mass Spec-Daten, den Zeilen als Funktionen und P-Splines.Ich bin mit NMR-Daten auf einige Schwierigkeiten gestoßen, aber ich muss diese Daten erneut aufrufen, um einige neue Dinge auszuprobieren.
Letztendlich verwende ich jedoch PLS oder Gen Reg, um die Vorhersagemodelle anzupassen, und ich verwende das Scannen von Elastic Net in Gen Reg, um einige wirklich gute Vorhersagemodelle zu finden, die den PLS-Modellen für kontinuierliche und binomiale Antwortdaten ebenbürtig oder besser sind.
Betreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieIch glaube, dass JMP Development in letzter Zeit einige gute Gespräche mit Kunden mit solchen Daten geführt hat. Sie haben also ein gutes Verständnis dafür, warum Spektral- und Chromatographiedaten (und ähnliches wie XRD) für FDE so schwierig sind, wie es jetzt ist. Hoffentlich finden sie Lösungen, die dies für neue Anwendungen und neue Benutzer von JMP Pro öffnen könnten!
Betreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieObwohl schon lange her:
Nur um die Kommentare von Phil/Mike/Bill hinzuzufügen: Diese Art von Daten wird schwer mit FDE-Standardknoten zu passen sein. Sie möchten entweder Fourier ausprobieren (obwohl dies auf einer Seite überschwingen könnte) oder P-Splines, bei denen Sie die Knoten näher an den Spitzenvariationen anpassen. Dies wird dazu beitragen, den Glättungseffekt zu eliminieren. Oft ist dies nicht wichtig, aber wenn Sie sich für die verschiedenen Positionen der Peaks interessieren (Höhe, Höhe, ...), kann dies wichtig werden.
Aus meiner früheren Arbeit bei Seismographie- und Signalverarbeitungskunden war das Filtern des Rauschens wichtig, da es FDE immer noch an guten Filtertechniken mangelt. Dies würde meiner Meinung nach bei der Datenverarbeitung sehr helfen.
Ich würde es jedoch versuchen und sehen, wie gut Sie (derzeit) sein können. Obwohl ich nichtlineare und Curfe-Fit-Plattformen mag, bin ich nicht so überzeugt, dass sie auch einen anständigen Job machen werden
Betreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieAus meiner Erfahrung mit Kunden sind IR-Spektren und Chromatographie nützliche Anwendungen von FDE. GSK hat einige Male präsentiert, wie sie FDE zur Optimierung einer Chromatographiemethode eingesetzt haben (obwohl sie die Präsentation nicht teilen konnten). Ich habe einen anderen Kunden, der sich FTIR-Spektren ansieht.
In beiden Fällen betrachteten sie nicht das gesamte Spektrum/Chromatogramm. Sie konzentrieren sich auf bestimmte Regionen/Höhepunkte von Interesse.
Die obigen Beispiele sehen für mich etwas "beschäftigt" aus, und ich denke, FDE könnte Probleme haben. Aber es hängt wirklich von der Situation ab - was die Art der Variation von Funktion zu Funktion ist und was sie aus den Daten herausfinden wollen.
Das Subtrahieren der Baseline ist in diesen Situationen eine übliche Datenvorbereitung. Es gibt derzeit keine einfache Möglichkeit, dies in FDE zu tun, aber hoffentlich wird es hinzugefügt.
Werfen Sie einen Blick auf Root Integrated Function Square als eine der zusammenfassenden FDE-Statistiken, die für die Fläche unter der Kurve hilfreich sein könnten.Betreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieHey!
Vielleicht eine andere Perspektive aus @Bill_Worley . Die NIR-Daten aus dem PLS-Buch sind ein großartiges Beispiel für IR-Spektren, die wirklich gut mit FDE funktionieren. Wenn die Peaks des Spektrums schärfer werden, sinkt die Fähigkeit, eine wirklich gute Spur zu erstellen. Die Funktion versucht, das obere/untere Spitzenbit zu runden. Ich hatte dieses Problem mit einigen XRD-Spektren, Massenspektrometern und NMR. Das heißt, Sie können immer noch viele gute Informationen aus der Spur gewinnen (Identifizieren aktiver Regionen in den Spektren usw. ... siehe Pete's Discovery Talk ...) Ich finde auch, dass es für Leute, die neu in das Thema einsteigen, viel einfacher ist, sich mit diesem PLS auseinanderzusetzen. Ich konnte mit FDE Fuß fassen, wo PLS einfach über ihre Köpfe hinweggeht.
Für die Chromatographie, insbesondere die AUC-Berechnung, sollten Sie sich für Nonlinear oder Fit Curve (IMO) entscheiden. Möglicherweise können Sie FDE jedoch verwenden, um das von Bill erwähnte Rauschen zu beheben ... eine Art Datenbereinigungsschritt.
Am besten,
MBetreff: Antrag auf Funktionsdaten zur Infrarotspektroskopie und ChromatographieHyde,
Das von Ihnen gezeigte IR-Spektrum gilt für eine reine Verbindung.Wenn sie reine Verbindungen betrachten, können sie möglicherweise eine Kalibrierungskurve entwickeln.PLS wurde in der Vergangenheit sehr effektiv mit Spektraldaten verwendet.Wenn Sie das PLS-Buch haben, gibt es eine großartige Beschreibung zur Bestimmung der Oktanzahl in Benzin.Alles in allem zeigte Pete Hersh ein Beispiel für die Arbeit mit NIR-Daten in FDE bei Discovery, und Sie können ihn diesbezüglich kontaktieren.
Für die Chromatographie sind die Zeitpunkte die Elutionszeiten für bestimmte Verbindungen.Ich bin mir nicht sicher, ob FDE hier die richtige Antwort ist, es sei denn, Sie wollten Kurven aus verschiedenen Chargen vergleichen, aber ich habe mich schon einmal geirrt.Es gibt typischerweise auch bei der Chromatographie viel Grundlinienrauschen, das Sie erwähnen.Ich arbeite das gerne mit Ihnen durch, wenn Sie einige Daten von Ihrem Kunden erhalten.
Am besten,
Rechnung
