Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieJ'ai une question concernant l'utilisation de Functional Data Explorer sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographie.Des exemples de formes d'onde sont collés ci-dessous et j'essaie de faire en sorte que le client m'envoie un tableau de données.L'application doit les utiliser comme réponses du DOE.Pour la spectrographie infrarouge, la présence de pics à des nombres d'onde spécifiques est intéressante.Pour la chromatographie, l'aire sous la courbe à des points dans le temps (l'axe des x est le temps) est intéressante.Il y a également eu une discussion sur l'alignement de l'axe des x et la soustraction d'une réponse de base.
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/spectrpy/infrared/infrared.htm
https://www.researchgate.net/figure/High-performance-liquid-chromatography-HPLC-chromatograms-of-the-flavonoids-in-CN30_fig1_281614653
Objet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieSalut Martine,
Votre suggestion P-Splines est quelque chose avec lequel j'ai joué en utilisant FDE.Je n'ai pas encore essayé FT, mais je suis également sceptique quant au fait qu'il fera mieux qu'un ajustement spline... du moins pour les données spectrales.Une chose que j'ai trouvée qui semble bien fonctionner est d'utiliser les lignes comme fonctions au lieu d'empiler les données.J'ai eu de bons résultats avec les données NIR et Mass Spec les lignes en tant que fonctions et P-Splines.J'ai rencontré quelques difficultés avec les données RMN, mais j'ai besoin de revoir ces données pour essayer de nouvelles choses.
En fin de compte, j'utilise PLS ou Gen Reg pour ajuster les modèles prédictifs et j'utilise le balayage Elastic Net dans Gen Reg pour trouver de très bons modèles prédictifs qui sont à égalité ou meilleurs que les modèles PLS pour les données de réponse continues et binomiales.
Objet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieJe pense que JMP Development a récemment eu de bonnes discussions avec des clients disposant de données comme celle-ci. Ils ont donc une bonne compréhension des raisons pour lesquelles les données spectrales et chromatographiques (et similaires telles que XRD) sont difficiles pour la FDE comme c'est le cas actuellement. Espérons qu'ils pourront trouver des solutions qui pourraient ouvrir cela à de nouvelles applications et à de nouveaux utilisateurs de JMP Pro !
Objet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieBien qu'il y a déjà longtemps :
Juste pour ajouter aux commentaires de Phil/Mike/Bill : ce type de données sera difficile à adapter aux nœuds standard FDE. vous voulez soit essayer le fourier (bien que cela puisse déborder d'un côté) ou les P-Splines où vous ajustez les nœuds plus près des variations maximales. Cela aidera à éliminer l'effet de lissage. Souvent ce n'est pas important mais si vous vous intéressez aux différentes positions des pics (hight, auc, ...) cela peut devenir important.
De mon travail passé avec des clients sismographiques et de traitement du signal, le filtrage du bruit était important, il manque encore à FDE de bonnes techniques de filtrage. Cela aiderait beaucoup dans le traitement des données, je crois.
Cependant, je voudrais essayer et voir à quel point vous pouvez être bon (actuellement). Bien que j'aime la plate-forme non linéaire et curfe fit, je ne suis pas convaincu qu'ils feront du bon travail non plus
Objet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieD'après mon expérience avec les clients, les spectres IR et la chromatographie sont des applications utiles de FDE. GSK a présenté à plusieurs reprises comment ils ont utilisé FDE pour optimiser une méthode de chromatographie (bien qu'ils n'aient pas pu partager la présentation). J'ai un autre client qui regarde les spectres FTIR.
Dans les deux cas, ils ne regardaient pas l'ensemble du spectre/chromatogramme. Ils se concentrent sur des régions/pics d'intérêt particuliers.
Les exemples ci-dessus me semblent un peu "occupés" et je pense que FDE pourrait avoir du mal. Mais cela dépend vraiment de la situation - quelle est la nature de la variation de fonction à fonction et ce qu'ils veulent découvrir à partir des données.
La soustraction de la ligne de base est une préparation de données courante dans ces situations. Il n'y a pas de moyen facile de le faire dans FDE pour le moment, mais j'espère qu'il sera ajouté.
Jetez un œil à Root Integrated Function Square comme l'une des statistiques récapitulatives FDE qui pourraient être utiles pour l'aire sous la courbe.Objet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieHé!
Peut-être une perspective différente de @Bill_Worley . Les données NIR du livre PLS sont un excellent exemple de spectre IR qui fonctionnera très bien avec FDE. Lorsque les pics de spectre deviennent plus nets, la capacité de faire un très bon tracé diminue. La fonction essaie d'arrondir le bit pointu supérieur/inférieur. J'ai eu ce problème avec certains spectres XRD, Mass Spec et RMN. Cela dit, vous pouvez toujours obtenir beaucoup de bonnes informations à partir de la trace (identifier les régions actives dans les spectres, etc... voir Pete's Discovery Talk...) Je trouve également qu'il est beaucoup plus facile pour les personnes qui découvrent le sujet de comprendre ce PLS. J'ai pu obtenir une traction avec FDE où PLS passe juste au-dessus de leurs têtes.
Pour la chromatographie, en particulier les calculs AUC, vous allez vouloir opter pour Nonlinear ou Fit Curve (IMO). Cependant, vous pourrez peut-être utiliser FDE pour traiter le bruit mentionné par Bill... en quelque sorte comme une étape de nettoyage des données.
Meilleur,
MObjet : Demande de données fonctionnelles sur la spectroscopie infrarouge et la chromatographieHyde,
Le spectre IR que vous montrez est pour un composé pur.S'ils examinent des composés purs, ils pourraient être en mesure de développer une courbe d'étalonnage.PLS a été utilisé très efficacement avec des données spectrales dans le passé.Si vous avez le livre PLS, il y a une excellente description sur la détermination de l'octane dans le gaz.Cela dit, Pete Hersh a montré un exemple de travail avec des données NIR dans FDE à Discovery et vous pouvez le contacter à ce sujet.
Pour la chromatographie, les points temporels sont les temps d'élution pour des composés spécifiques.À moins que vous ne vouliez comparer les courbes de différents lots, je ne suis pas sûr que FDE soit la bonne réponse ici, mais je me suis trompé auparavant.Il y a généralement beaucoup de bruit de base avec la chromatographie que vous mentionnez.Heureux de travailler avec vous si vous obtenez des données de votre client.
Meilleur,
Facture
