紅外光譜和色譜功能數據的應用我有一個關於在紅外光譜和色譜上使用 Functional Data Explorer 的問題。下面粘貼了示例波形,我正試圖讓客戶向我發送數據表。該應用程序將使用這些作為 DOE 的響應。對於紅外光譜,在特定波數處出現峰很有趣。對於色譜法,時間點(x 軸是時間)的曲線下面積很有趣。還討論了對齊 x 軸和減去基礎響應。
https://www2.chemistry.msu.edu/faculty/reusch/virttxtjml/spectrpy/infrared/infrared.htm
https://www.researchgate.net/figure/High-performance-liquid-chromatography-HPLC-chromatograms-of-the-flavonoids-in-CN30_fig1_281614653


回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用嘿馬丁,
你的建議 P-Splines 是我一直在使用 FDE 玩的東西。到目前為止,我還沒有嘗試過 FT,但我也懷疑它是否會比樣條擬合更好……至少對於光譜數據而言。我發現似乎效果很好的一件事是使用 Rows as Functions 而不是堆疊數據。我在 NIR 和質譜數據方面取得了很好的結果,行作為函數和 P-Splines。我確實遇到了核磁共振數據的一些困難,但我需要重新訪問該數據以嘗試一些新事物。
不過,最終,我使用 PLS 或 Gen Reg 來擬合預測模型,並且我在 Gen Reg 中使用掃描彈性網絡來找到一些非常好的預測模型,這些模型在連續和二項式響應數據方面與 PLS 模型相當或更好。
回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用我相信 JMP Development 最近與客戶就此類數據進行了一些很好的討論。 因此,他們很好地理解了為什麼光譜和色譜數據(以及 XRD 等類似數據)像現在這樣難以用於 FDE。 希望他們能夠找到解決方案,為 JMP Pro 的新應用和新用戶打開這個大門!
回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用雖然很久以前:
補充一下 Phil/Mike/Bill 的評論:這種數據很難與 FDE 標準結相符。您要么想嘗試傅里葉(儘管這可能會在一側過度擺動)或 P-Splines,您可以在峰值變化周圍調整結點。 這將有助於消除平滑的影響。 通常這並不重要,但如果您對峰的不同位置(高度、auc 等)感興趣,這可能會變得很重要。
從我過去與地震和信號處理客戶的工作來看,過濾噪聲很重要,FDE 仍然缺乏良好的過濾技術。 我相信這將有助於數據處理。
但是,我會嘗試一下,看看你(目前)能有多好。 雖然我喜歡非線性和 curfe fit 平台,但我也不相信他們會做得很好
回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用根據我與客戶打交道的經驗,紅外光譜和色譜法是 FDE 的有用應用。 GSK 已經多次介紹了他們如何使用 FDE 來優化色譜方法(儘管他們無法分享演示文稿)。 我有另一個客戶在看 FTIR 光譜。
在這兩種情況下,他們都沒有查看整個光譜/色譜圖。 他們專注於感興趣的特定區域/峰。
上面的例子對我來說看起來有點“忙”,我認為 FDE 可能會遇到困難。 但這實際上取決於具體情況——功能間變化的性質是什麼,以及他們想從數據中找出什麼。
在這些情況下,減去基線是常見的數據準備。 現在在 FDE 中沒有簡單的方法可以做到這一點,但希望會被添加。
查看 Root Integrated Function Square 作為 FDE 匯總統計數據之一,可能對曲線下面積有幫助。回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用嘿!
也許從不同的角度@Bill_Worley . PLS 書中的 NIR 數據是 IR 光譜的一個很好的例子,它可以很好地與 FDE 配合使用。 當光譜峰變得更尖銳時,進行真正良好追踪的能力就會下降。 該函數嘗試舍入頂部/底部尖峰位。 我在一些 XRD 光譜、質譜和 NMR 上遇到過這個問題。 也就是說,您仍然可以從跡線中獲得很多有用的信息(識別光譜中的活動區域等......請參閱 Pete 的發現講座......) 我還發現,對於剛接觸該主題的人來說,圍繞 PLS 思考要容易得多。 我已經能夠在 FDE 中獲得牽引力,而 PLS 就在他們頭上。
對於色譜法,尤其是 AUC 計算,您需要使用非線性或擬合曲線 (IMO)。 不過,您也許可以使用 FDE 來解決 Bill 提到的噪音……有點像數據清理步驟。
最好的,
米回复:紅外光譜和色譜功能數據的應用海德,
您顯示的紅外光譜是純化合物的。如果他們正在研究純化合物,他們可能能夠制定校準曲線。過去,PLS 已非常有效地用於光譜數據。如果您有 PLS 書,則對確定氣體中的辛烷值有很好的描述。總而言之,Pete Hersh 在 Discovery 展示了在 FDE 中使用 NIR 數據的示例,您可以就此與他聯繫。
對於色譜法,時間點是特定化合物的洗脫時間。除非你想比較不同批次的曲線,否則我不確定 FDE 是這裡的正確答案,但我以前錯了。您提到的色譜法通常也有很多基線噪音。如果您從客戶那裡獲得一些數據,很高興與您一起解決這個問題。
最好的,
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