以下のスクリプトで、JMP12でバブルプロットでウェーハマップを描くことができました。気泡サイズは、ダイを表すために35に設定された。しかし、JMP13では、同じスクリプトと同じ設定が使用されている場合でも、バブルサイズは最小になりました。
Bubble Plot(
X( :X ),
Y( :Y ),
Coloring( :Vmin ),
Bubble Size( 37 ),
Size as Sum( 0 ),
Color as Sum( 1 ),
Label( "All" ),
Set Shape( "Square" ),
Color Theme( "Green Yellow Red" ),
Color Levels( [0.44 0.605 0.77 0.935 1.1] ),
Fit to Window( "Off" ),
Title Position( 0, 0 ));

これを報告してくれてありがとう - Bubble Size()はBubble Plot()の引数として機能していないようですが、プラットフォームが作成された後にメッセージを送信すれば機能します。
bp=BubblePlot(...);
bp << Bubble Size(37);
この問題は将来のリリースで修正される予定です。