SAS，JMP和JMP Genomics團隊於5月24日至25日在SAS校園舉辦了第七次面對面的MicroArray質量控制（MAQC）聯盟會議。在過去幾年中，MAQC吸引了生物技術和製藥，芯片製造商和分析提供商的思想領袖的極大關注，包括SAS的開發人員和測試人員，特別是由Russ Wolfinger領導的JMP Genomics團隊的成員。
SAS執行副總裁兼JMP開發人員John Sall週四早上為MAQC會議提供了開場白，並評論了SAS在生命科學領域的悠久歷史。他還分享了一些關於SAS歷史的有趣的花絮，特別是舉辦會議的Building V的歷史，該會議以前都是視頻遊戲開發和運動商業廣告的製作！也許我只是SAS的新人，已經在這裡待了一年，但是Building V歷史中的那些章節對我來說都是新聞......
已經要求MAQC會議的與會者保持對科學報告內容的保密，因為它們將成為未來出版物的基礎。但是，MAQC的目標無論如何都不是秘密。他們清楚地說明了 FDA主頁為MAQC ：“MAQC項目的目的是為微陣列社區提供質量控制工具，以避免程序失敗，並通過向公眾提供大量參考數據集以及易於獲取的參考RNA樣本來製定微陣列數據分析指南。”
JMP Genomics團隊和SAS的其他團隊參加了去年9月在Nature Biotechnology上發表的MAQC第一階段的幾篇論文，並參與了第二階段數據集的分析工作。第二階段的一個總體目標是提供有關使用基因組數據構建穩健預測模型的方法的指導。再加上用戶對JMP Genomics中擴展預測建模的需求，該MAQC目標有助於推動JMP Genomics 3.0大大擴展的預測建模功能的開發。開發團隊添加了徑向基礎機器流程和交叉驗證模型比較平台，可輕鬆比較大型預測模型組（同一類型和不同類型的模型）的性能。在過去的幾個月裡，這些能力已經非常清楚，這些能力使JMP Genomics在基因組分析領域的競爭中脫穎而出。
從我的角度來看，MAQC參與者對可用於分析基因組學數據的統計技術和方法有很大的科學興趣，但也真正希望看到優質的基因組學數據用於有益於人類健康並支持藥物開發過程。隨著將基因組學數據（VGDS）自願提交到藥物批准過程中，FDA明確希望對基因組學數據分析進行更嚴格的分析過程探索和標準化。MAQC的FDA協調員已經介入以促進該領域的研究，科學家和軟件開發人員都可以從他們的研究結果和出版物中學到很多東西。
在SAS舉行的MAQC會議上，一項特別令人興奮的公共發展是MAQC全基因組協會（WGA）研究小組的宣布。同 JMP Genomics 3.0 ，我們支持分析一些非常大的WGA數據集。我們最近使用500k個SNP基因型對4000個樣本進行了基準測試，其中一些基因型為4000個樣本中的每個樣本提供了高達100萬個SNP。我毫不懷疑SAS和JMP Genomics開發人員將積極參與WGA研究小組的未來發展方向，並將他們所學到的知識融入到JMP Genomics中令人驚嘆的遺傳學分析能力的未來改進中。
我個人感謝John Sall，JMP Marketing以及SAS的所有其他人，他們幫助計劃並支持這個為期兩天的重要活動！
