<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Titolo: C32 Utilizzo della spettrometria di massa e dell'analisi discriminante ampia PLS multivariata per lo screening del cancro alla prostata (Bartell)
Autore: Pietro Bartell
Appunti: Ho incluso la solita narrazione play by play di MS Word, un diario, un foglio di lavoro Excel utilizzato per dimostrare la procedura guidata di importazione di Excel, la tabella dei dati JMP di base, nonché il documento originale che mi ha ispirato nello sviluppo del caso.
Perchè buono:
- Interessante caso HLS
- Custodia completa che include istruzioni, importazione di fogli di calcolo, diario JMP e diapositive da lasciare
- Le tabelle di dati supportano l'uso delle funzionalità di JMP Multivariate e JMP Pro Predictive Modeling
- Fase 1: inserimento dei dati in JMP - Generatore di query, procedura guidata di importazione di Excel
- Fase 2: Esplorazione e screening - Distribuzione, Fit Y per X, Multivariato, Componenti principali
- Fase 3: Costruzione e valutazione dei modelli - Analisi discriminante
- Fase 4: Comunica/Condividi - Esportazione di massa in PowerPoint e Word
Allegati:
- MassSpec.jrn
- MassSpecCase.doc
- MassSpecCase.pptx
- MassSpecStudy.jmp
- MassSpecStudy.xlsx
- Proteomica cellulare Mol-2005-Wright-545-54.pdf
Aggiornamento rapido a questo. Predictor Screening può essere utilizzato per escludere i predittori e in JMP Pro 17 è anche possibile utilizzare Response Screening con le proteine inserite nel ruolo Switch se si desidera valutare ogni proteina separatamente come SNP-Trait o analisi in stile GWAS.
Il clustering viene utilizzato anche per vedere gruppi di proteine che potrebbero avere profili simili per distinguere i due gruppi.
Un altro ideale è utilizzare Model Screening se si sta pensando non solo di trovare un pannello di proteine (diagnostico), ma anche di utilizzarlo per prevedere e ottenere risultati (prognostici).
