<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Titel: C32 unter Verwendung von Massenspektrometrie und multivariater PLS-weiter Diskriminanzanalyse für das Prostatakrebs-Screening (Bartell)
Autor: Peter Bartell
Anmerkungen: Ich habe die übliche MS-Word-Play-by-Play-Erzählung, ein Tagebuch, ein Excel-Arbeitsblatt zur Demonstration des Excel-Import-Assistenten, die JMP-Kerndatentabelle sowie das Originalpapier beigefügt, das mir bei der Entwicklung des Falles als Inspiration diente.
Warum gut:
- Interessanter HLS-Fall
- Vollständiger Koffer inklusive Anleitung, Tabellenimport, JMP-Journal und zurückgelassenen Folien
- Datentabellen unterstützen die Verwendung der JMP Multivariate- und JMP Pro Predictive Modeling-Funktionen
- Phase 1: Daten in JMP importieren – Query Builder, Excel-Import-Assistent
- Phase 2: Erkunden und Screening – Verteilung, Y an X anpassen, Multivariat, Hauptkomponenten
- Phase 3: Modelle erstellen und bewerten – Diskriminanzanalyse
- Phase 4: Kommunizieren/Teilen – Massenexport nach PowerPoint und Word
Anhänge:
- MassSpec.jrn
- MassSpecCase.doc
- MassSpecCase.pptx
- MassSpecStudy.jmp
- MassSpecStudy.xlsx
- Mol Cell Proteomics-2005-Wright-545-54.pdf
Kurzes Update dazu. Prädiktor-Screening kann zum Aussortieren von Prädiktoren verwendet werden, und in JMP Pro 17 können Sie auch Antwort-Screening mit den Proteinen verwenden, die in die Switch-Rolle versetzt werden, wenn Sie jedes Protein separat bewerten möchten, z. B. bei einer SNP-Merkmals- oder GWAS-Analyse.
Clustering wird auch verwendet, um Gruppen von Proteinen zu erkennen, die möglicherweise ähnliche Profile zur Unterscheidung der beiden Gruppen aufweisen.
Ein weiteres Ideal ist die Verwendung des Modell-Screenings, wenn man nicht nur daran denkt, eine Reihe von Proteinen zu finden (diagnostisch), sondern auch zur Vorhersage und zum Ergebnis zu verwenden (prognostisch).
